Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW8

Parp3, Poly [ADP-ribose] polymerase, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp3Q3ULW8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Parp3Q3ULW8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Parp3Q3ULW8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Parp3Q3ULW8 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Parp3Q3ULW8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Parp3Q3ULW8 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Parp3Q3ULW8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Parp3Q3ULW8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Parp3Q3ULW8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Parp3Q3ULW8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Parp3Q3ULW8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Parp3Q3ULW8 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Parp3Q3ULW8 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Parp3Q3ULW8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Parp3Q3ULW8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Parp3Q3ULW8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Parp3Q3ULW8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Parp3Q3ULW8 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Parp3Q3ULW8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Parp3Q3ULW8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Parp3Q3ULW8 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Parp3Q3ULW8 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Parp3Q3ULW8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Parp3Q3ULW8 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Parp3Q3ULW8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Parp3Q3ULW8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Parp3Q3ULW8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Parp3Q3ULW8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Parp3Q3ULW8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Parp3Q3ULW8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Parp3Q3ULW8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Parp3Q3ULW8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Parp3Q3ULW8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Parp3Q3ULW8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Parp3Q3ULW8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Parp3Q3ULW8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Parp3Q3ULW8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Parp3Q3ULW8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Parp3Q3ULW8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Parp3Q3ULW8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Parp3Q3ULW8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Parp3Q3ULW8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Parp3Q3ULW8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Parp3Q3ULW8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Parp3Q3ULW8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Parp3Q3ULW8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Parp3Q3ULW8 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Parp3Q3ULW8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Parp3Q3ULW8 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Parp3Q3ULW8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Parp3Q3ULW8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Parp3Q3ULW8 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Parp3Q3ULW8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Parp3Q3ULW8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Parp3Q3ULW8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Parp3Q3ULW8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Parp3Q3ULW8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Parp3Q3ULW8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Parp3Q3ULW8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Parp3Q3ULW8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Parp3Q3ULW8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Parp3Q3ULW8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Parp3Q3ULW8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Parp3Q3ULW8 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Parp3Q3ULW8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Parp3Q3ULW8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Parp3Q3ULW8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Parp3Q3ULW8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Parp3Q3ULW8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Parp3Q3ULW8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Parp3Q3ULW8 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Parp3Q3ULW8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Parp3Q3ULW8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Parp3Q3ULW8 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Parp3Q3ULW8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Parp3Q3ULW8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Parp3Q3ULW8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Parp3Q3ULW8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Parp3Q3ULW8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Parp3Q3ULW8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Parp3Q3ULW8 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Parp3Q3ULW8 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Parp3Q3ULW8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Parp3Q3ULW8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Parp3Q3ULW8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Parp3Q3ULW8 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Parp3Q3ULW8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Parp3Q3ULW8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Parp3Q3ULW8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Parp3Q3ULW8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Parp3Q3ULW8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Parp3Q3ULW8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Parp3Q3ULW8 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Parp3Q3ULW8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Parp3Q3ULW8 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Parp3Q3ULW8 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Parp3Q3ULW8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Parp3Q3ULW8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Parp3Q3ULW8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Parp3Q3ULW8 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms