Protein–RNA interactions for Protein: Q3U285

Lcorl, Ligand-dependent nuclear receptor corepressor-like protein, mousemouse

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Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LcorlQ3U285 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LcorlQ3U285 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LcorlQ3U285 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LcorlQ3U285 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LcorlQ3U285 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LcorlQ3U285 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LcorlQ3U285 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LcorlQ3U285 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LcorlQ3U285 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LcorlQ3U285 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LcorlQ3U285 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LcorlQ3U285 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LcorlQ3U285 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LcorlQ3U285 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LcorlQ3U285 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LcorlQ3U285 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LcorlQ3U285 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LcorlQ3U285 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LcorlQ3U285 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LcorlQ3U285 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LcorlQ3U285 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LcorlQ3U285 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LcorlQ3U285 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LcorlQ3U285 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LcorlQ3U285 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
LcorlQ3U285 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LcorlQ3U285 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LcorlQ3U285 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
LcorlQ3U285 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
LcorlQ3U285 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LcorlQ3U285 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LcorlQ3U285 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
LcorlQ3U285 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LcorlQ3U285 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LcorlQ3U285 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LcorlQ3U285 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
LcorlQ3U285 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LcorlQ3U285 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LcorlQ3U285 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LcorlQ3U285 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LcorlQ3U285 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LcorlQ3U285 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LcorlQ3U285 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LcorlQ3U285 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LcorlQ3U285 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LcorlQ3U285 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LcorlQ3U285 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LcorlQ3U285 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LcorlQ3U285 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LcorlQ3U285 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LcorlQ3U285 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LcorlQ3U285 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LcorlQ3U285 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LcorlQ3U285 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LcorlQ3U285 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LcorlQ3U285 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
LcorlQ3U285 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LcorlQ3U285 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LcorlQ3U285 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LcorlQ3U285 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LcorlQ3U285 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LcorlQ3U285 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LcorlQ3U285 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
LcorlQ3U285 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LcorlQ3U285 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LcorlQ3U285 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LcorlQ3U285 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LcorlQ3U285 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LcorlQ3U285 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LcorlQ3U285 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LcorlQ3U285 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LcorlQ3U285 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LcorlQ3U285 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LcorlQ3U285 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LcorlQ3U285 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LcorlQ3U285 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LcorlQ3U285 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LcorlQ3U285 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LcorlQ3U285 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LcorlQ3U285 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LcorlQ3U285 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LcorlQ3U285 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LcorlQ3U285 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LcorlQ3U285 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LcorlQ3U285 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
LcorlQ3U285 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LcorlQ3U285 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LcorlQ3U285 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LcorlQ3U285 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LcorlQ3U285 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LcorlQ3U285 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LcorlQ3U285 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LcorlQ3U285 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LcorlQ3U285 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LcorlQ3U285 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LcorlQ3U285 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LcorlQ3U285 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LcorlQ3U285 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
LcorlQ3U285 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LcorlQ3U285 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms