Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0V1

Khsrp, Far upstream element-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 748 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KhsrpQ3U0V1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KhsrpQ3U0V1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
KhsrpQ3U0V1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KhsrpQ3U0V1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KhsrpQ3U0V1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KhsrpQ3U0V1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KhsrpQ3U0V1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KhsrpQ3U0V1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KhsrpQ3U0V1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KhsrpQ3U0V1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KhsrpQ3U0V1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KhsrpQ3U0V1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KhsrpQ3U0V1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KhsrpQ3U0V1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KhsrpQ3U0V1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KhsrpQ3U0V1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KhsrpQ3U0V1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KhsrpQ3U0V1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KhsrpQ3U0V1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KhsrpQ3U0V1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KhsrpQ3U0V1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KhsrpQ3U0V1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
KhsrpQ3U0V1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KhsrpQ3U0V1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KhsrpQ3U0V1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KhsrpQ3U0V1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KhsrpQ3U0V1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KhsrpQ3U0V1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KhsrpQ3U0V1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KhsrpQ3U0V1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KhsrpQ3U0V1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KhsrpQ3U0V1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KhsrpQ3U0V1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
KhsrpQ3U0V1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KhsrpQ3U0V1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KhsrpQ3U0V1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KhsrpQ3U0V1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KhsrpQ3U0V1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KhsrpQ3U0V1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KhsrpQ3U0V1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KhsrpQ3U0V1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KhsrpQ3U0V1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KhsrpQ3U0V1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KhsrpQ3U0V1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KhsrpQ3U0V1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KhsrpQ3U0V1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
KhsrpQ3U0V1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KhsrpQ3U0V1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KhsrpQ3U0V1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KhsrpQ3U0V1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KhsrpQ3U0V1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KhsrpQ3U0V1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KhsrpQ3U0V1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KhsrpQ3U0V1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KhsrpQ3U0V1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KhsrpQ3U0V1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KhsrpQ3U0V1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KhsrpQ3U0V1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KhsrpQ3U0V1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KhsrpQ3U0V1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KhsrpQ3U0V1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KhsrpQ3U0V1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KhsrpQ3U0V1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KhsrpQ3U0V1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KhsrpQ3U0V1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KhsrpQ3U0V1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KhsrpQ3U0V1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KhsrpQ3U0V1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KhsrpQ3U0V1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
KhsrpQ3U0V1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KhsrpQ3U0V1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KhsrpQ3U0V1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KhsrpQ3U0V1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KhsrpQ3U0V1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KhsrpQ3U0V1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KhsrpQ3U0V1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KhsrpQ3U0V1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KhsrpQ3U0V1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KhsrpQ3U0V1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KhsrpQ3U0V1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KhsrpQ3U0V1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KhsrpQ3U0V1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
KhsrpQ3U0V1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KhsrpQ3U0V1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KhsrpQ3U0V1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KhsrpQ3U0V1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KhsrpQ3U0V1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KhsrpQ3U0V1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KhsrpQ3U0V1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KhsrpQ3U0V1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KhsrpQ3U0V1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
KhsrpQ3U0V1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KhsrpQ3U0V1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KhsrpQ3U0V1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
KhsrpQ3U0V1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
KhsrpQ3U0V1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KhsrpQ3U0V1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KhsrpQ3U0V1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KhsrpQ3U0V1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KhsrpQ3U0V1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
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