Protein–RNA interactions for Protein: Q3TT38

D17Wsu92e, Uncharacterized protein C6orf106 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D17Wsu92eQ3TT38 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
D17Wsu92eQ3TT38 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
D17Wsu92eQ3TT38 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
D17Wsu92eQ3TT38 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
D17Wsu92eQ3TT38 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
D17Wsu92eQ3TT38 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
D17Wsu92eQ3TT38 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
D17Wsu92eQ3TT38 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
D17Wsu92eQ3TT38 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
D17Wsu92eQ3TT38 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
D17Wsu92eQ3TT38 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
D17Wsu92eQ3TT38 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
D17Wsu92eQ3TT38 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
D17Wsu92eQ3TT38 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
D17Wsu92eQ3TT38 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
D17Wsu92eQ3TT38 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
D17Wsu92eQ3TT38 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
D17Wsu92eQ3TT38 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
D17Wsu92eQ3TT38 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
D17Wsu92eQ3TT38 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
D17Wsu92eQ3TT38 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
D17Wsu92eQ3TT38 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
D17Wsu92eQ3TT38 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
D17Wsu92eQ3TT38 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
D17Wsu92eQ3TT38 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
D17Wsu92eQ3TT38 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
D17Wsu92eQ3TT38 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
D17Wsu92eQ3TT38 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
D17Wsu92eQ3TT38 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
D17Wsu92eQ3TT38 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
D17Wsu92eQ3TT38 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
D17Wsu92eQ3TT38 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
D17Wsu92eQ3TT38 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
D17Wsu92eQ3TT38 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
D17Wsu92eQ3TT38 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
D17Wsu92eQ3TT38 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
D17Wsu92eQ3TT38 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
D17Wsu92eQ3TT38 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
D17Wsu92eQ3TT38 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
D17Wsu92eQ3TT38 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
D17Wsu92eQ3TT38 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
D17Wsu92eQ3TT38 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
D17Wsu92eQ3TT38 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
D17Wsu92eQ3TT38 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
D17Wsu92eQ3TT38 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
D17Wsu92eQ3TT38 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
D17Wsu92eQ3TT38 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
D17Wsu92eQ3TT38 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
D17Wsu92eQ3TT38 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
D17Wsu92eQ3TT38 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
D17Wsu92eQ3TT38 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
D17Wsu92eQ3TT38 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
D17Wsu92eQ3TT38 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
D17Wsu92eQ3TT38 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
D17Wsu92eQ3TT38 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
D17Wsu92eQ3TT38 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
D17Wsu92eQ3TT38 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
D17Wsu92eQ3TT38 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
D17Wsu92eQ3TT38 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
D17Wsu92eQ3TT38 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
D17Wsu92eQ3TT38 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
D17Wsu92eQ3TT38 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
D17Wsu92eQ3TT38 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
D17Wsu92eQ3TT38 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
D17Wsu92eQ3TT38 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
D17Wsu92eQ3TT38 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
D17Wsu92eQ3TT38 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
D17Wsu92eQ3TT38 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
D17Wsu92eQ3TT38 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
D17Wsu92eQ3TT38 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
D17Wsu92eQ3TT38 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
D17Wsu92eQ3TT38 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
D17Wsu92eQ3TT38 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
D17Wsu92eQ3TT38 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
D17Wsu92eQ3TT38 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
D17Wsu92eQ3TT38 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
D17Wsu92eQ3TT38 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
D17Wsu92eQ3TT38 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
D17Wsu92eQ3TT38 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
D17Wsu92eQ3TT38 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
D17Wsu92eQ3TT38 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
D17Wsu92eQ3TT38 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
D17Wsu92eQ3TT38 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
D17Wsu92eQ3TT38 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
D17Wsu92eQ3TT38 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
D17Wsu92eQ3TT38 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
D17Wsu92eQ3TT38 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
D17Wsu92eQ3TT38 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
D17Wsu92eQ3TT38 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
D17Wsu92eQ3TT38 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
D17Wsu92eQ3TT38 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
D17Wsu92eQ3TT38 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
D17Wsu92eQ3TT38 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
D17Wsu92eQ3TT38 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
D17Wsu92eQ3TT38 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
D17Wsu92eQ3TT38 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
D17Wsu92eQ3TT38 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
D17Wsu92eQ3TT38 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
D17Wsu92eQ3TT38 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
D17Wsu92eQ3TT38 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms