Protein–RNA interactions for Protein: Q3MIT2

PUS10, Putative tRNA pseudouridine synthase Pus10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS10Q3MIT2 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PUS10Q3MIT2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PUS10Q3MIT2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PUS10Q3MIT2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PUS10Q3MIT2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PUS10Q3MIT2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PUS10Q3MIT2 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PUS10Q3MIT2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PUS10Q3MIT2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PUS10Q3MIT2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PUS10Q3MIT2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PUS10Q3MIT2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PUS10Q3MIT2 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PUS10Q3MIT2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PUS10Q3MIT2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PUS10Q3MIT2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PUS10Q3MIT2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PUS10Q3MIT2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PUS10Q3MIT2 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PUS10Q3MIT2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PUS10Q3MIT2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PUS10Q3MIT2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PUS10Q3MIT2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PUS10Q3MIT2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PUS10Q3MIT2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PUS10Q3MIT2 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PUS10Q3MIT2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PUS10Q3MIT2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PUS10Q3MIT2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PUS10Q3MIT2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PUS10Q3MIT2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PUS10Q3MIT2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PUS10Q3MIT2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PUS10Q3MIT2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PUS10Q3MIT2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PUS10Q3MIT2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PUS10Q3MIT2 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PUS10Q3MIT2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PUS10Q3MIT2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PUS10Q3MIT2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PUS10Q3MIT2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PUS10Q3MIT2 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PUS10Q3MIT2 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PUS10Q3MIT2 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PUS10Q3MIT2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PUS10Q3MIT2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PUS10Q3MIT2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PUS10Q3MIT2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PUS10Q3MIT2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PUS10Q3MIT2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PUS10Q3MIT2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PUS10Q3MIT2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PUS10Q3MIT2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PUS10Q3MIT2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PUS10Q3MIT2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PUS10Q3MIT2 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PUS10Q3MIT2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PUS10Q3MIT2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PUS10Q3MIT2 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PUS10Q3MIT2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PUS10Q3MIT2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PUS10Q3MIT2 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PUS10Q3MIT2 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PUS10Q3MIT2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PUS10Q3MIT2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PUS10Q3MIT2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PUS10Q3MIT2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PUS10Q3MIT2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PUS10Q3MIT2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PUS10Q3MIT2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PUS10Q3MIT2 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PUS10Q3MIT2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PUS10Q3MIT2 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PUS10Q3MIT2 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PUS10Q3MIT2 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PUS10Q3MIT2 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PUS10Q3MIT2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PUS10Q3MIT2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PUS10Q3MIT2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PUS10Q3MIT2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PUS10Q3MIT2 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PUS10Q3MIT2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PUS10Q3MIT2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PUS10Q3MIT2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PUS10Q3MIT2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PUS10Q3MIT2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PUS10Q3MIT2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PUS10Q3MIT2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PUS10Q3MIT2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PUS10Q3MIT2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PUS10Q3MIT2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PUS10Q3MIT2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PUS10Q3MIT2 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PUS10Q3MIT2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PUS10Q3MIT2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PUS10Q3MIT2 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PUS10Q3MIT2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PUS10Q3MIT2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PUS10Q3MIT2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PUS10Q3MIT2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms