Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN0

KRTAP25-1, Keratin-associated protein 25-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP25-1Q3LHN0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
KRTAP25-1Q3LHN0 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
KRTAP25-1Q3LHN0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
KRTAP25-1Q3LHN0 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
KRTAP25-1Q3LHN0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
KRTAP25-1Q3LHN0 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
KRTAP25-1Q3LHN0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
KRTAP25-1Q3LHN0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
KRTAP25-1Q3LHN0 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
KRTAP25-1Q3LHN0 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
KRTAP25-1Q3LHN0 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
KRTAP25-1Q3LHN0 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
KRTAP25-1Q3LHN0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
KRTAP25-1Q3LHN0 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
KRTAP25-1Q3LHN0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
KRTAP25-1Q3LHN0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
KRTAP25-1Q3LHN0 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
KRTAP25-1Q3LHN0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
KRTAP25-1Q3LHN0 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
KRTAP25-1Q3LHN0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
KRTAP25-1Q3LHN0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
KRTAP25-1Q3LHN0 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
KRTAP25-1Q3LHN0 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
KRTAP25-1Q3LHN0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
KRTAP25-1Q3LHN0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
KRTAP25-1Q3LHN0 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
KRTAP25-1Q3LHN0 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
KRTAP25-1Q3LHN0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
KRTAP25-1Q3LHN0 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
KRTAP25-1Q3LHN0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
KRTAP25-1Q3LHN0 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
KRTAP25-1Q3LHN0 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
KRTAP25-1Q3LHN0 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
KRTAP25-1Q3LHN0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
KRTAP25-1Q3LHN0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
KRTAP25-1Q3LHN0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
KRTAP25-1Q3LHN0 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
KRTAP25-1Q3LHN0 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
KRTAP25-1Q3LHN0 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
KRTAP25-1Q3LHN0 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
KRTAP25-1Q3LHN0 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
KRTAP25-1Q3LHN0 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
KRTAP25-1Q3LHN0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.62
KRTAP25-1Q3LHN0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
KRTAP25-1Q3LHN0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
KRTAP25-1Q3LHN0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
KRTAP25-1Q3LHN0 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
KRTAP25-1Q3LHN0 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
KRTAP25-1Q3LHN0 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
KRTAP25-1Q3LHN0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
KRTAP25-1Q3LHN0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
KRTAP25-1Q3LHN0 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
KRTAP25-1Q3LHN0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
KRTAP25-1Q3LHN0 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
KRTAP25-1Q3LHN0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
KRTAP25-1Q3LHN0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
KRTAP25-1Q3LHN0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
KRTAP25-1Q3LHN0 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
KRTAP25-1Q3LHN0 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
KRTAP25-1Q3LHN0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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KRTAP25-1Q3LHN0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
KRTAP25-1Q3LHN0 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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KRTAP25-1Q3LHN0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
KRTAP25-1Q3LHN0 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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KRTAP25-1Q3LHN0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
KRTAP25-1Q3LHN0 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
KRTAP25-1Q3LHN0 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
KRTAP25-1Q3LHN0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
KRTAP25-1Q3LHN0 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
KRTAP25-1Q3LHN0 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
KRTAP25-1Q3LHN0 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
KRTAP25-1Q3LHN0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
KRTAP25-1Q3LHN0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
KRTAP25-1Q3LHN0 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
KRTAP25-1Q3LHN0 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
KRTAP25-1Q3LHN0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
KRTAP25-1Q3LHN0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
KRTAP25-1Q3LHN0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
KRTAP25-1Q3LHN0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
KRTAP25-1Q3LHN0 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
KRTAP25-1Q3LHN0 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
KRTAP25-1Q3LHN0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
KRTAP25-1Q3LHN0 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
KRTAP25-1Q3LHN0 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
KRTAP25-1Q3LHN0 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
KRTAP25-1Q3LHN0 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
KRTAP25-1Q3LHN0 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
KRTAP25-1Q3LHN0 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
KRTAP25-1Q3LHN0 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
KRTAP25-1Q3LHN0 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
KRTAP25-1Q3LHN0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
KRTAP25-1Q3LHN0 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
KRTAP25-1Q3LHN0 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
KRTAP25-1Q3LHN0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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