Protein–RNA interactions for Protein: Q16881

TXNRD1, Thioredoxin reductase 1, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNRD1Q16881 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
TXNRD1Q16881 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC31.57■■■□□ 2.64
TXNRD1Q16881 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
TXNRD1Q16881 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
TXNRD1Q16881 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC31.56■■■□□ 2.64
TXNRD1Q16881 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
TXNRD1Q16881 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC31.56■■■□□ 2.64
TXNRD1Q16881 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
TXNRD1Q16881 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
TXNRD1Q16881 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
TXNRD1Q16881 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
TXNRD1Q16881 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
TXNRD1Q16881 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
TXNRD1Q16881 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
TXNRD1Q16881 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
TXNRD1Q16881 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
TXNRD1Q16881 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
TXNRD1Q16881 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
TXNRD1Q16881 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC31.54■■■□□ 2.64
TXNRD1Q16881 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC31.54■■■□□ 2.64
TXNRD1Q16881 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC31.53■■■□□ 2.64
TXNRD1Q16881 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
TXNRD1Q16881 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
TXNRD1Q16881 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
TXNRD1Q16881 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
TXNRD1Q16881 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
TXNRD1Q16881 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.64
TXNRD1Q16881 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
TXNRD1Q16881 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
TXNRD1Q16881 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
TXNRD1Q16881 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
TXNRD1Q16881 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
TXNRD1Q16881 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC31.5■■■□□ 2.63
TXNRD1Q16881 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
TXNRD1Q16881 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
TXNRD1Q16881 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC31.5■■■□□ 2.63
TXNRD1Q16881 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
TXNRD1Q16881 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
TXNRD1Q16881 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
TXNRD1Q16881 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
TXNRD1Q16881 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
TXNRD1Q16881 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC31.49■■■□□ 2.63
TXNRD1Q16881 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
TXNRD1Q16881 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
TXNRD1Q16881 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
TXNRD1Q16881 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
TXNRD1Q16881 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
TXNRD1Q16881 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
TXNRD1Q16881 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC31.47■■■□□ 2.63
TXNRD1Q16881 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
TXNRD1Q16881 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
TXNRD1Q16881 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC31.47■■■□□ 2.63
TXNRD1Q16881 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
TXNRD1Q16881 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
TXNRD1Q16881 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
TXNRD1Q16881 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
TXNRD1Q16881 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
TXNRD1Q16881 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
TXNRD1Q16881 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC31.45■■■□□ 2.63
TXNRD1Q16881 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC31.45■■■□□ 2.63
TXNRD1Q16881 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
TXNRD1Q16881 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
TXNRD1Q16881 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC31.43■■■□□ 2.62
TXNRD1Q16881 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
TXNRD1Q16881 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
TXNRD1Q16881 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
TXNRD1Q16881 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
TXNRD1Q16881 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
TXNRD1Q16881 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC31.42■■■□□ 2.62
TXNRD1Q16881 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
TXNRD1Q16881 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
TXNRD1Q16881 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
TXNRD1Q16881 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
TXNRD1Q16881 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC31.41■■■□□ 2.62
TXNRD1Q16881 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
TXNRD1Q16881 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
TXNRD1Q16881 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
TXNRD1Q16881 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
TXNRD1Q16881 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
TXNRD1Q16881 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
TXNRD1Q16881 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
TXNRD1Q16881 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
TXNRD1Q16881 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
TXNRD1Q16881 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
TXNRD1Q16881 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
TXNRD1Q16881 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
TXNRD1Q16881 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
TXNRD1Q16881 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
TXNRD1Q16881 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC31.37■■■□□ 2.61
TXNRD1Q16881 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
TXNRD1Q16881 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
TXNRD1Q16881 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
TXNRD1Q16881 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
TXNRD1Q16881 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
TXNRD1Q16881 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
TXNRD1Q16881 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
TXNRD1Q16881 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC31.35■■■□□ 2.61
TXNRD1Q16881 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
TXNRD1Q16881 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
TXNRD1Q16881 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC31.35■■■□□ 2.61
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