Protein–RNA interactions for Protein: Q16739

UGCG, Ceramide glucosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UGCGQ16739 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
UGCGQ16739 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
UGCGQ16739 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
UGCGQ16739 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
UGCGQ16739 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
UGCGQ16739 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
UGCGQ16739 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
UGCGQ16739 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
UGCGQ16739 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
UGCGQ16739 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
UGCGQ16739 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
UGCGQ16739 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
UGCGQ16739 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
UGCGQ16739 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
UGCGQ16739 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
UGCGQ16739 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
UGCGQ16739 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
UGCGQ16739 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
UGCGQ16739 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
UGCGQ16739 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
UGCGQ16739 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
UGCGQ16739 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
UGCGQ16739 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
UGCGQ16739 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
UGCGQ16739 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
UGCGQ16739 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
UGCGQ16739 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
UGCGQ16739 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
UGCGQ16739 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
UGCGQ16739 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
UGCGQ16739 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
UGCGQ16739 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
UGCGQ16739 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
UGCGQ16739 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
UGCGQ16739 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
UGCGQ16739 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
UGCGQ16739 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
UGCGQ16739 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
UGCGQ16739 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
UGCGQ16739 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
UGCGQ16739 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
UGCGQ16739 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
UGCGQ16739 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
UGCGQ16739 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
UGCGQ16739 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
UGCGQ16739 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
UGCGQ16739 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
UGCGQ16739 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
UGCGQ16739 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
UGCGQ16739 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
UGCGQ16739 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
UGCGQ16739 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
UGCGQ16739 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
UGCGQ16739 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
UGCGQ16739 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
UGCGQ16739 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
UGCGQ16739 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
UGCGQ16739 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
UGCGQ16739 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
UGCGQ16739 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
UGCGQ16739 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
UGCGQ16739 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
UGCGQ16739 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
UGCGQ16739 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
UGCGQ16739 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
UGCGQ16739 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
UGCGQ16739 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
UGCGQ16739 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
UGCGQ16739 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
UGCGQ16739 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
UGCGQ16739 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
UGCGQ16739 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
UGCGQ16739 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
UGCGQ16739 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
UGCGQ16739 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
UGCGQ16739 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
UGCGQ16739 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
UGCGQ16739 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
UGCGQ16739 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
UGCGQ16739 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
UGCGQ16739 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
UGCGQ16739 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
UGCGQ16739 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
UGCGQ16739 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
UGCGQ16739 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
UGCGQ16739 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
UGCGQ16739 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
UGCGQ16739 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
UGCGQ16739 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
UGCGQ16739 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
UGCGQ16739 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
UGCGQ16739 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
UGCGQ16739 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
UGCGQ16739 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
UGCGQ16739 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
UGCGQ16739 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
UGCGQ16739 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
UGCGQ16739 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
UGCGQ16739 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
UGCGQ16739 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 175.6 ms