Protein–RNA interactions for Protein: Q16630

CPSF6, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 6, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF6Q16630 BUB1B-209ENST00000559733 786 ntTSL 35.7□□□□□ -1.58e-9■■□□□ 13.3
CPSF6Q16630 BUB1B-203ENST00000557848 633 ntTSL 34.91□□□□□ -1.628e-9■■□□□ 13.3
CPSF6Q16630 BUB1B-210ENST00000559772 560 ntTSL 44.04□□□□□ -1.768e-9■■□□□ 13.3
CPSF6Q16630 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.235e-6■■□□□ 13.3
CPSF6Q16630 C16orf72-202ENST00000574285 10359 ntTSL 24.98□□□□□ -1.615e-6■■□□□ 13.3
CPSF6Q16630 AC087190.4-201ENST00000574616 8334 ntBASIC4.14□□□□□ -1.755e-6■■□□□ 13.3
CPSF6Q16630 CD46-202ENST00000322918 3124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.982e-7■■□□□ 13.3
CPSF6Q16630 CD46-206ENST00000360212 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.082e-7■■□□□ 13.3
CPSF6Q16630 CD46-205ENST00000358170 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.12e-7■■□□□ 13.3
CPSF6Q16630 CD46-208ENST00000367042 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.122e-7■■□□□ 13.3
CPSF6Q16630 CD46-209ENST00000367047 3089 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.142e-7■■□□□ 13.3
CPSF6Q16630 CD46-203ENST00000354848 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.212e-7■■□□□ 13.3
CPSF6Q16630 CD46-204ENST00000357714 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.212e-7■■□□□ 13.3
CPSF6Q16630 CD46-201ENST00000322875 3278 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.222e-7■■□□□ 13.3
CPSF6Q16630 CD46-207ENST00000367041 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.222e-7■■□□□ 13.3
CPSF6Q16630 CD46-212ENST00000469535 7826 ntTSL 1 (best)7.08□□□□□ -1.282e-7■■□□□ 13.3
CPSF6Q16630 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.031e-6■■□□□ 13.2
CPSF6Q16630 YTHDC1-201ENST00000344157 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.441e-6■■□□□ 13.2
CPSF6Q16630 YTHDC1-207ENST00000579690 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.491e-6■■□□□ 13.2
CPSF6Q16630 METAP2-211ENST00000553151 564 ntTSL 515.79■□□□□ 0.129e-14■■□□□ 13.2
CPSF6Q16630 METAP2-203ENST00000535095 2431 ntTSL 215.23■□□□□ 0.039e-14■■□□□ 13.2
CPSF6Q16630 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.229e-14■■□□□ 13.2
CPSF6Q16630 METAP2-209ENST00000550777 1779 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.479e-14■■□□□ 13.2
CPSF6Q16630 METAP2-201ENST00000261220 1836 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.59e-14■■□□□ 13.2
CPSF6Q16630 METAP2-210ENST00000551840 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.819e-14■■□□□ 13.2
CPSF6Q16630 METAP2-202ENST00000323666 3601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.929e-14■■□□□ 13.2
CPSF6Q16630 METAP2-207ENST00000549502 513 ntTSL 46.48□□□□□ -1.379e-14■■□□□ 13.2
CPSF6Q16630 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.077e-7■■□□□ 13.2
CPSF6Q16630 DNAJC2-207ENST00000464253 1809 ntTSL 1 (best)9.29□□□□□ -0.927e-7■■□□□ 13.2
CPSF6Q16630 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.647e-7■■□□□ 13.2
CPSF6Q16630 DNAJC2-208ENST00000475065 1952 ntTSL 1 (best)2.88□□□□□ -1.957e-7■■□□□ 13.2
CPSF6Q16630 NCL-205ENST00000453992 964 ntTSL 418.34■□□□□ 0.533e-29■■□□□ 13.2
CPSF6Q16630 NCL-203ENST00000417652 568 ntTSL 46.53□□□□□ -1.363e-29■■□□□ 13.2
CPSF6Q16630 NCL-206ENST00000454824 606 ntTSL 36.53□□□□□ -1.363e-29■■□□□ 13.2
CPSF6Q16630 NCL-204ENST00000436894 562 ntTSL 45.88□□□□□ -1.473e-29■■□□□ 13.2
CPSF6Q16630 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.051e-6■■□□□ 13.1
CPSF6Q16630 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.041e-6■■□□□ 13.1
CPSF6Q16630 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.011e-6■■□□□ 13.1
CPSF6Q16630 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.021e-6■■□□□ 13.1
CPSF6Q16630 CCDC82-204ENST00000525786 550 ntTSL 414.8□□□□□ -0.041e-6■■□□□ 13.1
CPSF6Q16630 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.161e-6■■□□□ 13.1
CPSF6Q16630 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.161e-6■■□□□ 13.1
CPSF6Q16630 AC079594.2-201ENST00000483754 3360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.541e-6■■□□□ 13.1
CPSF6Q16630 TRIM59-201ENST00000309784 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.671e-6■■□□□ 13.1
CPSF6Q16630 AC139887.2-201ENST00000503571 531 ntTSL 4 BASIC10.43□□□□□ -0.741e-6■■□□□ 13.1
CPSF6Q16630 TRIM59-208ENST00000543469 4615 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.171e-6■■□□□ 13.1
CPSF6Q16630 CCDC82-207ENST00000538597 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 37.58□□□□□ -1.21e-6■■□□□ 13.1
CPSF6Q16630 CCDC82-203ENST00000524836 492 ntTSL 35.86□□□□□ -1.471e-6■■□□□ 13.1
CPSF6Q16630 OPA1-212ENST00000445863 1096 ntTSL 34.91□□□□□ -1.621e-6■■□□□ 13.1
CPSF6Q16630 OPA1-210ENST00000429164 393 ntTSL 34.6□□□□□ -1.671e-6■■□□□ 13.1
CPSF6Q16630 PSMC5-203ENST00000578570 1680 ntTSL 220.5■□□□□ 0.875e-6■■□□□ 13.1
CPSF6Q16630 MAP1LC3B-206ENST00000564844 3085 ntTSL 1 (best)20.05■□□□□ 0.85e-6■■□□□ 13.1
CPSF6Q16630 PSMC5-210ENST00000581764 2107 ntTSL 518.16■□□□□ 0.55e-6■■□□□ 13.1
CPSF6Q16630 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.365e-6■■□□□ 13.1
CPSF6Q16630 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.215e-6■■□□□ 13.1
CPSF6Q16630 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.145e-6■■□□□ 13.1
CPSF6Q16630 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.125e-6■■□□□ 13.1
CPSF6Q16630 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.15e-6■■□□□ 13.1
CPSF6Q16630 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.035e-6■■□□□ 13.1
CPSF6Q16630 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.095e-6■■□□□ 13.1
CPSF6Q16630 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.15e-6■■□□□ 13.1
CPSF6Q16630 PSMC5-213ENST00000582130 828 ntTSL 314.35□□□□□ -0.115e-6■■□□□ 13.1
CPSF6Q16630 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.135e-6■■□□□ 13.1
CPSF6Q16630 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.145e-6■■□□□ 13.1
CPSF6Q16630 PSMC5-217ENST00000584536 804 ntTSL 513.92□□□□□ -0.185e-6■■□□□ 13.1
CPSF6Q16630 PPARGC1B-206ENST00000461780 566 ntTSL 413.68□□□□□ -0.225e-6■■□□□ 13.1
CPSF6Q16630 PPIL2-211ENST00000498109 563 ntTSL 213.24□□□□□ -0.295e-6■■□□□ 13.1
CPSF6Q16630 PPARGC1B-202ENST00000360453 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.295e-6■■□□□ 13.1
CPSF6Q16630 PSMC5-220ENST00000585123 899 ntTSL 513.09□□□□□ -0.315e-6■■□□□ 13.1
CPSF6Q16630 COX17-202ENST00000468918 555 ntTSL 412.87□□□□□ -0.355e-6■■□□□ 13.1
CPSF6Q16630 PSMC5-216ENST00000584320 804 ntTSL 512.83□□□□□ -0.365e-6■■□□□ 13.1
CPSF6Q16630 PRDM2-213ENST00000503842 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.365e-6■■□□□ 13.1
CPSF6Q16630 PSMC5-212ENST00000581882 1474 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.395e-6■■□□□ 13.1
CPSF6Q16630 PSMC5-201ENST00000310144 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.425e-6■■□□□ 13.1
CPSF6Q16630 PPIL2-201ENST00000335025 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.475e-6■■□□□ 13.1
CPSF6Q16630 CEP192-212ENST00000540847 2485 ntTSL 212.09□□□□□ -0.475e-6■■□□□ 13.1
CPSF6Q16630 PSMC5-205ENST00000579147 2586 ntTSL 211.68□□□□□ -0.545e-6■■□□□ 13.1
CPSF6Q16630 PRDM2-204ENST00000376048 2688 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.555e-6■■□□□ 13.1
CPSF6Q16630 PRDM2-214ENST00000505823 568 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.615e-6■■□□□ 13.1
CPSF6Q16630 COX17-205ENST00000490145 513 ntTSL 510.7□□□□□ -0.75e-6■■□□□ 13.1
CPSF6Q16630 COX17-201ENST00000261070 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.755e-6■■□□□ 13.1
CPSF6Q16630 PSMC5-206ENST00000579708 558 ntTSL 49.97□□□□□ -0.815e-6■■□□□ 13.1
CPSF6Q16630 PPIL2-204ENST00000417788 4213 ntTSL 29.91□□□□□ -0.825e-6■■□□□ 13.1
CPSF6Q16630 CEP95-203ENST00000556440 3139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.875e-6■■□□□ 13.1
CPSF6Q16630 PSMC5-221ENST00000585242 1178 ntTSL 59.51□□□□□ -0.895e-6■■□□□ 13.1
CPSF6Q16630 COX17-203ENST00000484810 471 ntTSL 2 BASIC9.41□□□□□ -0.95e-6■■□□□ 13.1
CPSF6Q16630 PPIL2-203ENST00000406385 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.935e-6■■□□□ 13.1
CPSF6Q16630 PSMC5-211ENST00000581842 809 ntTSL 59.13□□□□□ -0.955e-6■■□□□ 13.1
CPSF6Q16630 CEP192-210ENST00000513183 703 ntTSL 39.1□□□□□ -0.955e-6■■□□□ 13.1
CPSF6Q16630 PPIL2-210ENST00000496819 494 ntTSL 1 (best)9.07□□□□□ -0.965e-6■■□□□ 13.1
CPSF6Q16630 CEP192-208ENST00000510237 6548 ntTSL 1 (best)8.43□□□□□ -1.065e-6■■□□□ 13.1
CPSF6Q16630 CEP192-202ENST00000430049 3286 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.095e-6■■□□□ 13.1
CPSF6Q16630 CEP95-201ENST00000553412 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.125e-6■■□□□ 13.1
CPSF6Q16630 PPIL2-208ENST00000484439 863 ntTSL 57.98□□□□□ -1.135e-6■■□□□ 13.1
CPSF6Q16630 COX17-207ENST00000497997 565 ntTSL 27.74□□□□□ -1.175e-6■■□□□ 13.1
CPSF6Q16630 BMS1-201ENST00000374518 7753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.215e-6■■□□□ 13.1
CPSF6Q16630 PRDM2-201ENST00000235372 7957 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.215e-6■■□□□ 13.1
CPSF6Q16630 CEP95-211ENST00000580285 2681 ntTSL 57.36□□□□□ -1.235e-6■■□□□ 13.1
CPSF6Q16630 CEP95-215ENST00000582698 442 ntTSL 27.3□□□□□ -1.245e-6■■□□□ 13.1
CPSF6Q16630 COX17-204ENST00000486606 430 ntTSL 36.92□□□□□ -1.35e-6■■□□□ 13.1
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