Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC18A3Q16572 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC18A3Q16572 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC18A3Q16572 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC18A3Q16572 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC18A3Q16572 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC18A3Q16572 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC18A3Q16572 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC18A3Q16572 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC18A3Q16572 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC18A3Q16572 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC18A3Q16572 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC18A3Q16572 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC18A3Q16572 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC18A3Q16572 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC18A3Q16572 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC18A3Q16572 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC18A3Q16572 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC18A3Q16572 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC18A3Q16572 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC18A3Q16572 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC18A3Q16572 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC18A3Q16572 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC18A3Q16572 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC18A3Q16572 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC18A3Q16572 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC18A3Q16572 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC18A3Q16572 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC18A3Q16572 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC18A3Q16572 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC18A3Q16572 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC18A3Q16572 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC18A3Q16572 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC18A3Q16572 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC18A3Q16572 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC18A3Q16572 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC18A3Q16572 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC18A3Q16572 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC18A3Q16572 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC18A3Q16572 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC18A3Q16572 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC18A3Q16572 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC18A3Q16572 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC18A3Q16572 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC18A3Q16572 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC18A3Q16572 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC18A3Q16572 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC18A3Q16572 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC18A3Q16572 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC18A3Q16572 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC18A3Q16572 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC18A3Q16572 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC18A3Q16572 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC18A3Q16572 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC18A3Q16572 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC18A3Q16572 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC18A3Q16572 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC18A3Q16572 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC18A3Q16572 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC18A3Q16572 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC18A3Q16572 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC18A3Q16572 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC18A3Q16572 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC18A3Q16572 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC18A3Q16572 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC18A3Q16572 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC18A3Q16572 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC18A3Q16572 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC18A3Q16572 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC18A3Q16572 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC18A3Q16572 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC18A3Q16572 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC18A3Q16572 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC18A3Q16572 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC18A3Q16572 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC18A3Q16572 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC18A3Q16572 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC18A3Q16572 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC18A3Q16572 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC18A3Q16572 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC18A3Q16572 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC18A3Q16572 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC18A3Q16572 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC18A3Q16572 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC18A3Q16572 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC18A3Q16572 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC18A3Q16572 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC18A3Q16572 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC18A3Q16572 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC18A3Q16572 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC18A3Q16572 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC18A3Q16572 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC18A3Q16572 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC18A3Q16572 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC18A3Q16572 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC18A3Q16572 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC18A3Q16572 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC18A3Q16572 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC18A3Q16572 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC18A3Q16572 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
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