Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEDD8Q15843 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEDD8Q15843 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEDD8Q15843 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEDD8Q15843 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEDD8Q15843 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEDD8Q15843 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEDD8Q15843 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEDD8Q15843 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEDD8Q15843 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEDD8Q15843 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEDD8Q15843 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
NEDD8Q15843 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
NEDD8Q15843 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
NEDD8Q15843 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEDD8Q15843 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NEDD8Q15843 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEDD8Q15843 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEDD8Q15843 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEDD8Q15843 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NEDD8Q15843 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEDD8Q15843 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEDD8Q15843 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEDD8Q15843 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEDD8Q15843 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEDD8Q15843 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEDD8Q15843 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEDD8Q15843 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEDD8Q15843 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEDD8Q15843 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NEDD8Q15843 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEDD8Q15843 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEDD8Q15843 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEDD8Q15843 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEDD8Q15843 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEDD8Q15843 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEDD8Q15843 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEDD8Q15843 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEDD8Q15843 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEDD8Q15843 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEDD8Q15843 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEDD8Q15843 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEDD8Q15843 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEDD8Q15843 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEDD8Q15843 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEDD8Q15843 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEDD8Q15843 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEDD8Q15843 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEDD8Q15843 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEDD8Q15843 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEDD8Q15843 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEDD8Q15843 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEDD8Q15843 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
NEDD8Q15843 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEDD8Q15843 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEDD8Q15843 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEDD8Q15843 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEDD8Q15843 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEDD8Q15843 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEDD8Q15843 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEDD8Q15843 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEDD8Q15843 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEDD8Q15843 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEDD8Q15843 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEDD8Q15843 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEDD8Q15843 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEDD8Q15843 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEDD8Q15843 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEDD8Q15843 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEDD8Q15843 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEDD8Q15843 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEDD8Q15843 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEDD8Q15843 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NEDD8Q15843 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NEDD8Q15843 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NEDD8Q15843 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NEDD8Q15843 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEDD8Q15843 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEDD8Q15843 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEDD8Q15843 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEDD8Q15843 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEDD8Q15843 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEDD8Q15843 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEDD8Q15843 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEDD8Q15843 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEDD8Q15843 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEDD8Q15843 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEDD8Q15843 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEDD8Q15843 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEDD8Q15843 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEDD8Q15843 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEDD8Q15843 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEDD8Q15843 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEDD8Q15843 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEDD8Q15843 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEDD8Q15843 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEDD8Q15843 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEDD8Q15843 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NEDD8Q15843 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NEDD8Q15843 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
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