Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
NCOA1Q15788 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
NCOA1Q15788 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC36.7■■■■□ 3.47
NCOA1Q15788 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
NCOA1Q15788 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.46
NCOA1Q15788 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC36.69■■■■□ 3.46
NCOA1Q15788 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
NCOA1Q15788 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
NCOA1Q15788 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
NCOA1Q15788 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
NCOA1Q15788 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
NCOA1Q15788 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
NCOA1Q15788 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
NCOA1Q15788 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
NCOA1Q15788 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
NCOA1Q15788 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
NCOA1Q15788 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
NCOA1Q15788 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
NCOA1Q15788 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
NCOA1Q15788 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
NCOA1Q15788 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
NCOA1Q15788 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
NCOA1Q15788 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
NCOA1Q15788 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
NCOA1Q15788 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
NCOA1Q15788 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC36.63■■■■□ 3.45
NCOA1Q15788 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
NCOA1Q15788 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
NCOA1Q15788 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
NCOA1Q15788 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
NCOA1Q15788 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
NCOA1Q15788 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
NCOA1Q15788 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC36.61■■■■□ 3.45
NCOA1Q15788 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC36.61■■■■□ 3.45
NCOA1Q15788 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
NCOA1Q15788 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC36.6■■■■□ 3.45
NCOA1Q15788 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
NCOA1Q15788 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
NCOA1Q15788 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
NCOA1Q15788 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
NCOA1Q15788 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
NCOA1Q15788 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
NCOA1Q15788 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
NCOA1Q15788 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC36.58■■■■□ 3.45
NCOA1Q15788 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
NCOA1Q15788 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
NCOA1Q15788 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC36.58■■■■□ 3.45
NCOA1Q15788 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
NCOA1Q15788 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.45
NCOA1Q15788 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
NCOA1Q15788 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
NCOA1Q15788 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
NCOA1Q15788 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
NCOA1Q15788 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC36.57■■■■□ 3.44
NCOA1Q15788 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
NCOA1Q15788 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
NCOA1Q15788 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
NCOA1Q15788 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
NCOA1Q15788 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
NCOA1Q15788 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC36.55■■■■□ 3.44
NCOA1Q15788 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
NCOA1Q15788 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
NCOA1Q15788 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
NCOA1Q15788 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
NCOA1Q15788 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
NCOA1Q15788 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
NCOA1Q15788 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
NCOA1Q15788 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
NCOA1Q15788 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
NCOA1Q15788 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
NCOA1Q15788 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC36.52■■■■□ 3.44
NCOA1Q15788 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
NCOA1Q15788 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
NCOA1Q15788 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
NCOA1Q15788 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
NCOA1Q15788 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
NCOA1Q15788 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
NCOA1Q15788 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
NCOA1Q15788 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.51■■■■□ 3.44
NCOA1Q15788 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.44
NCOA1Q15788 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
NCOA1Q15788 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
NCOA1Q15788 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.43
NCOA1Q15788 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.43
NCOA1Q15788 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC36.51■■■■□ 3.43
NCOA1Q15788 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC36.51■■■■□ 3.43
NCOA1Q15788 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
NCOA1Q15788 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC36.5■■■■□ 3.43
NCOA1Q15788 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
NCOA1Q15788 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
NCOA1Q15788 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
NCOA1Q15788 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
NCOA1Q15788 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
NCOA1Q15788 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
NCOA1Q15788 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
NCOA1Q15788 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
NCOA1Q15788 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
NCOA1Q15788 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
NCOA1Q15788 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC36.46■■■■□ 3.43
NCOA1Q15788 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
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