Protein–RNA interactions for Protein: Q15323

KRT31, Keratin, type I cuticular Ha1, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT31Q15323 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
KRT31Q15323 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
KRT31Q15323 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KRT31Q15323 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
KRT31Q15323 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KRT31Q15323 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KRT31Q15323 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KRT31Q15323 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
KRT31Q15323 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
KRT31Q15323 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KRT31Q15323 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
KRT31Q15323 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
KRT31Q15323 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
KRT31Q15323 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
KRT31Q15323 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
KRT31Q15323 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
KRT31Q15323 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
KRT31Q15323 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.51■■□□□ 1.84
KRT31Q15323 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
KRT31Q15323 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
KRT31Q15323 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
KRT31Q15323 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KRT31Q15323 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
KRT31Q15323 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KRT31Q15323 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
KRT31Q15323 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
KRT31Q15323 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KRT31Q15323 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
KRT31Q15323 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KRT31Q15323 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KRT31Q15323 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KRT31Q15323 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
KRT31Q15323 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
KRT31Q15323 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KRT31Q15323 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KRT31Q15323 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KRT31Q15323 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KRT31Q15323 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KRT31Q15323 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
KRT31Q15323 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KRT31Q15323 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KRT31Q15323 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KRT31Q15323 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KRT31Q15323 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KRT31Q15323 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KRT31Q15323 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KRT31Q15323 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KRT31Q15323 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KRT31Q15323 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KRT31Q15323 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KRT31Q15323 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KRT31Q15323 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
KRT31Q15323 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
KRT31Q15323 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
KRT31Q15323 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KRT31Q15323 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KRT31Q15323 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KRT31Q15323 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KRT31Q15323 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KRT31Q15323 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KRT31Q15323 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KRT31Q15323 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KRT31Q15323 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KRT31Q15323 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KRT31Q15323 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KRT31Q15323 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KRT31Q15323 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
KRT31Q15323 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KRT31Q15323 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KRT31Q15323 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KRT31Q15323 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KRT31Q15323 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KRT31Q15323 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
KRT31Q15323 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
KRT31Q15323 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
KRT31Q15323 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KRT31Q15323 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KRT31Q15323 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
KRT31Q15323 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KRT31Q15323 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
KRT31Q15323 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
KRT31Q15323 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
KRT31Q15323 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KRT31Q15323 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
KRT31Q15323 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
KRT31Q15323 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KRT31Q15323 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KRT31Q15323 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
KRT31Q15323 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KRT31Q15323 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
KRT31Q15323 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
KRT31Q15323 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KRT31Q15323 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KRT31Q15323 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
KRT31Q15323 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KRT31Q15323 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KRT31Q15323 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KRT31Q15323 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
KRT31Q15323 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KRT31Q15323 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms