Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IRF4Q15306 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IRF4Q15306 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IRF4Q15306 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IRF4Q15306 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IRF4Q15306 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IRF4Q15306 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IRF4Q15306 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IRF4Q15306 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IRF4Q15306 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IRF4Q15306 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IRF4Q15306 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IRF4Q15306 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IRF4Q15306 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IRF4Q15306 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IRF4Q15306 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IRF4Q15306 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
IRF4Q15306 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IRF4Q15306 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IRF4Q15306 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IRF4Q15306 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
IRF4Q15306 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IRF4Q15306 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IRF4Q15306 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IRF4Q15306 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IRF4Q15306 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
IRF4Q15306 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IRF4Q15306 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
IRF4Q15306 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
IRF4Q15306 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IRF4Q15306 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IRF4Q15306 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
IRF4Q15306 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
IRF4Q15306 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
IRF4Q15306 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24■■□□□ 1.43
IRF4Q15306 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
IRF4Q15306 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IRF4Q15306 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IRF4Q15306 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IRF4Q15306 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IRF4Q15306 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IRF4Q15306 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IRF4Q15306 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IRF4Q15306 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
IRF4Q15306 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IRF4Q15306 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IRF4Q15306 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
IRF4Q15306 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
IRF4Q15306 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
IRF4Q15306 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
IRF4Q15306 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
IRF4Q15306 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
IRF4Q15306 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
IRF4Q15306 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
IRF4Q15306 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
IRF4Q15306 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IRF4Q15306 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IRF4Q15306 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IRF4Q15306 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
IRF4Q15306 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
IRF4Q15306 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IRF4Q15306 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IRF4Q15306 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IRF4Q15306 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IRF4Q15306 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IRF4Q15306 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
IRF4Q15306 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
IRF4Q15306 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IRF4Q15306 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
IRF4Q15306 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IRF4Q15306 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IRF4Q15306 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IRF4Q15306 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IRF4Q15306 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
IRF4Q15306 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
IRF4Q15306 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
IRF4Q15306 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
IRF4Q15306 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IRF4Q15306 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
IRF4Q15306 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
IRF4Q15306 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IRF4Q15306 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IRF4Q15306 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IRF4Q15306 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IRF4Q15306 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IRF4Q15306 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IRF4Q15306 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IRF4Q15306 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
IRF4Q15306 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IRF4Q15306 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IRF4Q15306 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IRF4Q15306 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IRF4Q15306 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IRF4Q15306 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IRF4Q15306 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IRF4Q15306 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IRF4Q15306 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
IRF4Q15306 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
IRF4Q15306 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
IRF4Q15306 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms