Protein–RNA interactions for Protein: Q14761

PTPRCAP, Protein tyrosine phosphatase receptor type C-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAPQ14761 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRCAPQ14761 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRCAPQ14761 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRCAPQ14761 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRCAPQ14761 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRCAPQ14761 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRCAPQ14761 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRCAPQ14761 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRCAPQ14761 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRCAPQ14761 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRCAPQ14761 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRCAPQ14761 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRCAPQ14761 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRCAPQ14761 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRCAPQ14761 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRCAPQ14761 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRCAPQ14761 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRCAPQ14761 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRCAPQ14761 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRCAPQ14761 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRCAPQ14761 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRCAPQ14761 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRCAPQ14761 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRCAPQ14761 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRCAPQ14761 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRCAPQ14761 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRCAPQ14761 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRCAPQ14761 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRCAPQ14761 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRCAPQ14761 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRCAPQ14761 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPRCAPQ14761 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRCAPQ14761 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRCAPQ14761 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPRCAPQ14761 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRCAPQ14761 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRCAPQ14761 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRCAPQ14761 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRCAPQ14761 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRCAPQ14761 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRCAPQ14761 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPRCAPQ14761 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRCAPQ14761 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRCAPQ14761 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRCAPQ14761 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPRCAPQ14761 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRCAPQ14761 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRCAPQ14761 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRCAPQ14761 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRCAPQ14761 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRCAPQ14761 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRCAPQ14761 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRCAPQ14761 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRCAPQ14761 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRCAPQ14761 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRCAPQ14761 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRCAPQ14761 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRCAPQ14761 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRCAPQ14761 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRCAPQ14761 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRCAPQ14761 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRCAPQ14761 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRCAPQ14761 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRCAPQ14761 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRCAPQ14761 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRCAPQ14761 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRCAPQ14761 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRCAPQ14761 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRCAPQ14761 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRCAPQ14761 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRCAPQ14761 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRCAPQ14761 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRCAPQ14761 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRCAPQ14761 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRCAPQ14761 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRCAPQ14761 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRCAPQ14761 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRCAPQ14761 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRCAPQ14761 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRCAPQ14761 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRCAPQ14761 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRCAPQ14761 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRCAPQ14761 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRCAPQ14761 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRCAPQ14761 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRCAPQ14761 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PTPRCAPQ14761 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PTPRCAPQ14761 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PTPRCAPQ14761 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPRCAPQ14761 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPRCAPQ14761 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPRCAPQ14761 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPRCAPQ14761 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPRCAPQ14761 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRCAPQ14761 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRCAPQ14761 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRCAPQ14761 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRCAPQ14761 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRCAPQ14761 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRCAPQ14761 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms