Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SMC1AQ14683 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SMC1AQ14683 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SMC1AQ14683 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SMC1AQ14683 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SMC1AQ14683 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SMC1AQ14683 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SMC1AQ14683 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SMC1AQ14683 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SMC1AQ14683 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SMC1AQ14683 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SMC1AQ14683 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SMC1AQ14683 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SMC1AQ14683 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SMC1AQ14683 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SMC1AQ14683 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SMC1AQ14683 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SMC1AQ14683 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SMC1AQ14683 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SMC1AQ14683 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SMC1AQ14683 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SMC1AQ14683 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMC1AQ14683 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMC1AQ14683 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMC1AQ14683 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMC1AQ14683 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMC1AQ14683 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMC1AQ14683 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SMC1AQ14683 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
SMC1AQ14683 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SMC1AQ14683 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SMC1AQ14683 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SMC1AQ14683 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SMC1AQ14683 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SMC1AQ14683 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SMC1AQ14683 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SMC1AQ14683 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SMC1AQ14683 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SMC1AQ14683 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
SMC1AQ14683 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMC1AQ14683 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMC1AQ14683 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMC1AQ14683 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMC1AQ14683 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
SMC1AQ14683 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMC1AQ14683 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMC1AQ14683 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMC1AQ14683 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMC1AQ14683 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMC1AQ14683 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SMC1AQ14683 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SMC1AQ14683 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SMC1AQ14683 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SMC1AQ14683 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SMC1AQ14683 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SMC1AQ14683 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SMC1AQ14683 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SMC1AQ14683 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SMC1AQ14683 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SMC1AQ14683 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SMC1AQ14683 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SMC1AQ14683 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SMC1AQ14683 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SMC1AQ14683 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SMC1AQ14683 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
SMC1AQ14683 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SMC1AQ14683 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SMC1AQ14683 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SMC1AQ14683 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SMC1AQ14683 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SMC1AQ14683 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SMC1AQ14683 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SMC1AQ14683 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SMC1AQ14683 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SMC1AQ14683 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SMC1AQ14683 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SMC1AQ14683 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SMC1AQ14683 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SMC1AQ14683 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SMC1AQ14683 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SMC1AQ14683 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SMC1AQ14683 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SMC1AQ14683 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SMC1AQ14683 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SMC1AQ14683 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SMC1AQ14683 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SMC1AQ14683 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
SMC1AQ14683 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
SMC1AQ14683 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SMC1AQ14683 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SMC1AQ14683 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SMC1AQ14683 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SMC1AQ14683 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SMC1AQ14683 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SMC1AQ14683 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SMC1AQ14683 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SMC1AQ14683 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SMC1AQ14683 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SMC1AQ14683 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SMC1AQ14683 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
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