Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
CDK13Q14004 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC38.2■■■■□ 3.71
CDK13Q14004 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC38.2■■■■□ 3.71
CDK13Q14004 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
CDK13Q14004 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
CDK13Q14004 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
CDK13Q14004 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.19■■■■□ 3.7
CDK13Q14004 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.19■■■■□ 3.7
CDK13Q14004 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
CDK13Q14004 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
CDK13Q14004 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
CDK13Q14004 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC38.17■■■■□ 3.7
CDK13Q14004 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
CDK13Q14004 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
CDK13Q14004 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC38.17■■■■□ 3.7
CDK13Q14004 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
CDK13Q14004 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
CDK13Q14004 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC38.16■■■■□ 3.7
CDK13Q14004 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
CDK13Q14004 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
CDK13Q14004 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
CDK13Q14004 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
CDK13Q14004 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC38.16■■■■□ 3.7
CDK13Q14004 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC38.16■■■■□ 3.7
CDK13Q14004 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC38.15■■■■□ 3.7
CDK13Q14004 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
CDK13Q14004 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.15■■■■□ 3.7
CDK13Q14004 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
CDK13Q14004 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
CDK13Q14004 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.13■■■■□ 3.7
CDK13Q14004 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.13■■■■□ 3.69
CDK13Q14004 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC38.13■■■■□ 3.69
CDK13Q14004 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
CDK13Q14004 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC38.12■■■■□ 3.69
CDK13Q14004 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
CDK13Q14004 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
CDK13Q14004 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
CDK13Q14004 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
CDK13Q14004 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC38.11■■■■□ 3.69
CDK13Q14004 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
CDK13Q14004 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
CDK13Q14004 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
CDK13Q14004 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
CDK13Q14004 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC38.08■■■■□ 3.69
CDK13Q14004 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC38.07■■■■□ 3.68
CDK13Q14004 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
CDK13Q14004 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.06■■■■□ 3.68
CDK13Q14004 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
CDK13Q14004 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
CDK13Q14004 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
CDK13Q14004 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
CDK13Q14004 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
CDK13Q14004 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC38.04■■■■□ 3.68
CDK13Q14004 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC38.04■■■■□ 3.68
CDK13Q14004 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
CDK13Q14004 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
CDK13Q14004 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC38.03■■■■□ 3.68
CDK13Q14004 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC38.03■■■■□ 3.68
CDK13Q14004 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC38.03■■■■□ 3.68
CDK13Q14004 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
CDK13Q14004 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC38.02■■■■□ 3.68
CDK13Q14004 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.02■■■■□ 3.68
CDK13Q14004 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
CDK13Q14004 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.02■■■■□ 3.68
CDK13Q14004 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC38.01■■■■□ 3.67
CDK13Q14004 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
CDK13Q14004 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
CDK13Q14004 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC38■■■■□ 3.67
CDK13Q14004 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38■■■■□ 3.67
CDK13Q14004 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC38■■■■□ 3.67
CDK13Q14004 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38■■■■□ 3.67
CDK13Q14004 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
CDK13Q14004 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.99■■■■□ 3.67
CDK13Q14004 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.99■■■■□ 3.67
CDK13Q14004 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
CDK13Q14004 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC37.98■■■■□ 3.67
CDK13Q14004 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.98■■■■□ 3.67
CDK13Q14004 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC37.98■■■■□ 3.67
CDK13Q14004 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.98■■■■□ 3.67
CDK13Q14004 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
CDK13Q14004 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.97■■■■□ 3.67
CDK13Q14004 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC37.96■■■■□ 3.67
CDK13Q14004 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC37.96■■■■□ 3.67
CDK13Q14004 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.96■■■■□ 3.67
CDK13Q14004 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
CDK13Q14004 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
CDK13Q14004 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.95■■■■□ 3.67
CDK13Q14004 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
CDK13Q14004 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC37.95■■■■□ 3.67
CDK13Q14004 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.94■■■■□ 3.66
CDK13Q14004 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
CDK13Q14004 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
CDK13Q14004 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC37.94■■■■□ 3.66
CDK13Q14004 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC37.92■■■■□ 3.66
CDK13Q14004 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC37.92■■■■□ 3.66
CDK13Q14004 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
CDK13Q14004 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
CDK13Q14004 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
CDK13Q14004 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
CDK13Q14004 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC37.92■■■■□ 3.66
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