Protein–RNA interactions for Protein: Q13950

RUNX2, Runt-related transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX2Q13950 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RUNX2Q13950 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RUNX2Q13950 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RUNX2Q13950 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RUNX2Q13950 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RUNX2Q13950 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RUNX2Q13950 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RUNX2Q13950 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RUNX2Q13950 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RUNX2Q13950 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RUNX2Q13950 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RUNX2Q13950 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RUNX2Q13950 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RUNX2Q13950 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RUNX2Q13950 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RUNX2Q13950 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RUNX2Q13950 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RUNX2Q13950 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RUNX2Q13950 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RUNX2Q13950 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RUNX2Q13950 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RUNX2Q13950 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RUNX2Q13950 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RUNX2Q13950 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RUNX2Q13950 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RUNX2Q13950 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RUNX2Q13950 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RUNX2Q13950 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RUNX2Q13950 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RUNX2Q13950 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RUNX2Q13950 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RUNX2Q13950 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RUNX2Q13950 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RUNX2Q13950 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RUNX2Q13950 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RUNX2Q13950 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RUNX2Q13950 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RUNX2Q13950 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RUNX2Q13950 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RUNX2Q13950 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RUNX2Q13950 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RUNX2Q13950 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RUNX2Q13950 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RUNX2Q13950 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RUNX2Q13950 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RUNX2Q13950 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RUNX2Q13950 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RUNX2Q13950 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RUNX2Q13950 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RUNX2Q13950 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RUNX2Q13950 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RUNX2Q13950 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RUNX2Q13950 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RUNX2Q13950 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RUNX2Q13950 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RUNX2Q13950 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RUNX2Q13950 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RUNX2Q13950 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RUNX2Q13950 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RUNX2Q13950 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RUNX2Q13950 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RUNX2Q13950 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RUNX2Q13950 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RUNX2Q13950 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RUNX2Q13950 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RUNX2Q13950 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RUNX2Q13950 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RUNX2Q13950 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RUNX2Q13950 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RUNX2Q13950 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RUNX2Q13950 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RUNX2Q13950 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RUNX2Q13950 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RUNX2Q13950 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RUNX2Q13950 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RUNX2Q13950 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RUNX2Q13950 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RUNX2Q13950 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RUNX2Q13950 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RUNX2Q13950 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RUNX2Q13950 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RUNX2Q13950 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RUNX2Q13950 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RUNX2Q13950 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RUNX2Q13950 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RUNX2Q13950 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RUNX2Q13950 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RUNX2Q13950 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RUNX2Q13950 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RUNX2Q13950 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RUNX2Q13950 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RUNX2Q13950 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RUNX2Q13950 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RUNX2Q13950 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RUNX2Q13950 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RUNX2Q13950 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RUNX2Q13950 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RUNX2Q13950 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RUNX2Q13950 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RUNX2Q13950 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms