Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNA1CQ13936 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNA1CQ13936 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNA1CQ13936 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNA1CQ13936 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNA1CQ13936 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNA1CQ13936 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNA1CQ13936 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNA1CQ13936 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNA1CQ13936 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CACNA1CQ13936 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CACNA1CQ13936 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CACNA1CQ13936 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CACNA1CQ13936 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNA1CQ13936 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNA1CQ13936 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CACNA1CQ13936 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CACNA1CQ13936 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CACNA1CQ13936 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CACNA1CQ13936 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CACNA1CQ13936 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CACNA1CQ13936 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CACNA1CQ13936 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CACNA1CQ13936 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNA1CQ13936 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNA1CQ13936 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNA1CQ13936 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNA1CQ13936 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNA1CQ13936 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNA1CQ13936 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNA1CQ13936 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNA1CQ13936 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNA1CQ13936 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNA1CQ13936 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNA1CQ13936 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNA1CQ13936 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNA1CQ13936 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNA1CQ13936 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNA1CQ13936 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNA1CQ13936 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNA1CQ13936 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNA1CQ13936 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNA1CQ13936 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNA1CQ13936 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNA1CQ13936 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNA1CQ13936 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNA1CQ13936 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNA1CQ13936 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNA1CQ13936 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNA1CQ13936 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNA1CQ13936 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNA1CQ13936 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNA1CQ13936 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNA1CQ13936 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNA1CQ13936 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNA1CQ13936 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNA1CQ13936 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNA1CQ13936 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNA1CQ13936 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNA1CQ13936 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNA1CQ13936 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNA1CQ13936 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNA1CQ13936 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNA1CQ13936 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNA1CQ13936 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNA1CQ13936 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNA1CQ13936 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNA1CQ13936 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNA1CQ13936 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNA1CQ13936 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNA1CQ13936 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNA1CQ13936 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNA1CQ13936 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNA1CQ13936 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNA1CQ13936 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNA1CQ13936 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNA1CQ13936 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNA1CQ13936 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNA1CQ13936 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNA1CQ13936 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNA1CQ13936 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNA1CQ13936 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNA1CQ13936 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNA1CQ13936 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNA1CQ13936 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNA1CQ13936 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNA1CQ13936 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNA1CQ13936 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNA1CQ13936 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNA1CQ13936 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNA1CQ13936 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
CACNA1CQ13936 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CACNA1CQ13936 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CACNA1CQ13936 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CACNA1CQ13936 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CACNA1CQ13936 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CACNA1CQ13936 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CACNA1CQ13936 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CACNA1CQ13936 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNA1CQ13936 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
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