Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

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Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF2H2Q13888 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF2H2Q13888 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF2H2Q13888 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF2H2Q13888 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF2H2Q13888 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF2H2Q13888 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF2H2Q13888 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF2H2Q13888 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF2H2Q13888 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF2H2Q13888 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF2H2Q13888 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF2H2Q13888 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF2H2Q13888 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2H2Q13888 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2H2Q13888 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2H2Q13888 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2H2Q13888 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2H2Q13888 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2H2Q13888 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2H2Q13888 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2H2Q13888 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2H2Q13888 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2H2Q13888 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTF2H2Q13888 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTF2H2Q13888 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTF2H2Q13888 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTF2H2Q13888 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTF2H2Q13888 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTF2H2Q13888 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTF2H2Q13888 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF2H2Q13888 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF2H2Q13888 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF2H2Q13888 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF2H2Q13888 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF2H2Q13888 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF2H2Q13888 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF2H2Q13888 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GTF2H2Q13888 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GTF2H2Q13888 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GTF2H2Q13888 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GTF2H2Q13888 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GTF2H2Q13888 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GTF2H2Q13888 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
GTF2H2Q13888 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
GTF2H2Q13888 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GTF2H2Q13888 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GTF2H2Q13888 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GTF2H2Q13888 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GTF2H2Q13888 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GTF2H2Q13888 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GTF2H2Q13888 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF2H2Q13888 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF2H2Q13888 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF2H2Q13888 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF2H2Q13888 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF2H2Q13888 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF2H2Q13888 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF2H2Q13888 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF2H2Q13888 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF2H2Q13888 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF2H2Q13888 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF2H2Q13888 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF2H2Q13888 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF2H2Q13888 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF2H2Q13888 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF2H2Q13888 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF2H2Q13888 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF2H2Q13888 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF2H2Q13888 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF2H2Q13888 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF2H2Q13888 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF2H2Q13888 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF2H2Q13888 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF2H2Q13888 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF2H2Q13888 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF2H2Q13888 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF2H2Q13888 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF2H2Q13888 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF2H2Q13888 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF2H2Q13888 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF2H2Q13888 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF2H2Q13888 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF2H2Q13888 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF2H2Q13888 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF2H2Q13888 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GTF2H2Q13888 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GTF2H2Q13888 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GTF2H2Q13888 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GTF2H2Q13888 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GTF2H2Q13888 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GTF2H2Q13888 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GTF2H2Q13888 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GTF2H2Q13888 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GTF2H2Q13888 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GTF2H2Q13888 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GTF2H2Q13888 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GTF2H2Q13888 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF2H2Q13888 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF2H2Q13888 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
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