Protein–RNA interactions for Protein: Q13751

LAMB3, Laminin subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB3Q13751 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LAMB3Q13751 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LAMB3Q13751 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LAMB3Q13751 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LAMB3Q13751 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LAMB3Q13751 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LAMB3Q13751 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LAMB3Q13751 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LAMB3Q13751 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LAMB3Q13751 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LAMB3Q13751 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
LAMB3Q13751 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LAMB3Q13751 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LAMB3Q13751 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LAMB3Q13751 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LAMB3Q13751 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LAMB3Q13751 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LAMB3Q13751 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LAMB3Q13751 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LAMB3Q13751 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LAMB3Q13751 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LAMB3Q13751 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LAMB3Q13751 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LAMB3Q13751 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LAMB3Q13751 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LAMB3Q13751 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LAMB3Q13751 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LAMB3Q13751 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LAMB3Q13751 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LAMB3Q13751 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
LAMB3Q13751 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LAMB3Q13751 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LAMB3Q13751 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LAMB3Q13751 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LAMB3Q13751 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LAMB3Q13751 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
LAMB3Q13751 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
LAMB3Q13751 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LAMB3Q13751 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LAMB3Q13751 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LAMB3Q13751 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LAMB3Q13751 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LAMB3Q13751 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LAMB3Q13751 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LAMB3Q13751 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LAMB3Q13751 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LAMB3Q13751 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
LAMB3Q13751 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
LAMB3Q13751 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LAMB3Q13751 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LAMB3Q13751 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LAMB3Q13751 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
LAMB3Q13751 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LAMB3Q13751 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LAMB3Q13751 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LAMB3Q13751 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
LAMB3Q13751 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LAMB3Q13751 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LAMB3Q13751 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LAMB3Q13751 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LAMB3Q13751 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LAMB3Q13751 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
LAMB3Q13751 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LAMB3Q13751 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LAMB3Q13751 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LAMB3Q13751 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LAMB3Q13751 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LAMB3Q13751 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LAMB3Q13751 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LAMB3Q13751 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LAMB3Q13751 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LAMB3Q13751 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LAMB3Q13751 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LAMB3Q13751 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LAMB3Q13751 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LAMB3Q13751 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LAMB3Q13751 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LAMB3Q13751 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LAMB3Q13751 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LAMB3Q13751 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LAMB3Q13751 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LAMB3Q13751 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LAMB3Q13751 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
LAMB3Q13751 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LAMB3Q13751 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LAMB3Q13751 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LAMB3Q13751 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LAMB3Q13751 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LAMB3Q13751 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LAMB3Q13751 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LAMB3Q13751 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LAMB3Q13751 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LAMB3Q13751 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LAMB3Q13751 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LAMB3Q13751 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LAMB3Q13751 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LAMB3Q13751 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LAMB3Q13751 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LAMB3Q13751 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LAMB3Q13751 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
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