Protein–RNA interactions for Protein: Q13546

RIPK1, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 1, humanhuman

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Length 671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK1Q13546 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RIPK1Q13546 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RIPK1Q13546 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RIPK1Q13546 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RIPK1Q13546 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RIPK1Q13546 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RIPK1Q13546 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RIPK1Q13546 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RIPK1Q13546 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RIPK1Q13546 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RIPK1Q13546 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RIPK1Q13546 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RIPK1Q13546 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RIPK1Q13546 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RIPK1Q13546 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RIPK1Q13546 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RIPK1Q13546 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RIPK1Q13546 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RIPK1Q13546 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RIPK1Q13546 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RIPK1Q13546 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RIPK1Q13546 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RIPK1Q13546 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RIPK1Q13546 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RIPK1Q13546 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RIPK1Q13546 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RIPK1Q13546 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RIPK1Q13546 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RIPK1Q13546 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RIPK1Q13546 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RIPK1Q13546 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RIPK1Q13546 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RIPK1Q13546 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RIPK1Q13546 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RIPK1Q13546 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RIPK1Q13546 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RIPK1Q13546 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RIPK1Q13546 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RIPK1Q13546 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RIPK1Q13546 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RIPK1Q13546 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RIPK1Q13546 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RIPK1Q13546 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RIPK1Q13546 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RIPK1Q13546 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RIPK1Q13546 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RIPK1Q13546 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RIPK1Q13546 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RIPK1Q13546 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RIPK1Q13546 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RIPK1Q13546 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RIPK1Q13546 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RIPK1Q13546 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RIPK1Q13546 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RIPK1Q13546 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RIPK1Q13546 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RIPK1Q13546 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RIPK1Q13546 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RIPK1Q13546 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RIPK1Q13546 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RIPK1Q13546 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RIPK1Q13546 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RIPK1Q13546 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RIPK1Q13546 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RIPK1Q13546 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RIPK1Q13546 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RIPK1Q13546 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RIPK1Q13546 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RIPK1Q13546 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RIPK1Q13546 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RIPK1Q13546 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RIPK1Q13546 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RIPK1Q13546 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RIPK1Q13546 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RIPK1Q13546 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RIPK1Q13546 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RIPK1Q13546 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RIPK1Q13546 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RIPK1Q13546 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RIPK1Q13546 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RIPK1Q13546 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RIPK1Q13546 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RIPK1Q13546 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RIPK1Q13546 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RIPK1Q13546 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RIPK1Q13546 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RIPK1Q13546 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RIPK1Q13546 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RIPK1Q13546 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RIPK1Q13546 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RIPK1Q13546 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RIPK1Q13546 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RIPK1Q13546 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RIPK1Q13546 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RIPK1Q13546 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RIPK1Q13546 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RIPK1Q13546 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RIPK1Q13546 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RIPK1Q13546 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RIPK1Q13546 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
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