Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 AC005520.1-201ENST00000556551 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.883e-7■■■■■ 43.4
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PABPC4Q13310 ZNF410-202ENST00000334521 2193 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.223e-7■■■■■ 43.4
PABPC4Q13310 ZNF410-211ENST00000555044 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.393e-7■■■■■ 43.4
PABPC4Q13310 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.128e-9■■■■■ 43.4
PABPC4Q13310 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.17e-8■■■■■ 43.3
PABPC4Q13310 USP36-207ENST00000587010 607 ntTSL 317.33■□□□□ 0.367e-8■■■■■ 43.3
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PABPC4Q13310 USP36-221ENST00000592231 2479 ntTSL 215.73■□□□□ 0.117e-8■■■■■ 43.3
PABPC4Q13310 USP36-211ENST00000588130 602 ntTSL 210.52□□□□□ -0.737e-8■■■■■ 43.3
PABPC4Q13310 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.952e-7■■■■■ 43.3
PABPC4Q13310 SNCG-203ENST00000465679 641 ntTSL 216.14■□□□□ 0.172e-7■■■■■ 43.3
PABPC4Q13310 SNCG-202ENST00000372017 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.032e-7■■■■■ 43.3
PABPC4Q13310 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.115e-8■■■■■ 43.3
PABPC4Q13310 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.15e-8■■■■■ 43.3
PABPC4Q13310 PIGT-235ENST00000638967 2194 ntTSL 59.57□□□□□ -0.882e-7■■■■■ 43.2
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PABPC4Q13310 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.975e-9■■■■■ 43.2
PABPC4Q13310 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.885e-9■■■■■ 43.2
PABPC4Q13310 INO80E-203ENST00000540562 3064 ntTSL 215.64■□□□□ 0.095e-9■■■■■ 43.2
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PABPC4Q13310 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.074e-23■■■■■ 43.2
PABPC4Q13310 CHCHD1-202ENST00000372837 1202 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.14e-23■■■■■ 43.2
PABPC4Q13310 ANXA1-207ENST00000491192 1400 ntTSL 1 (best)6.25□□□□□ -1.412e-80■■■■■ 43.2
PABPC4Q13310 ANXA1-201ENST00000257497 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.492e-80■■■■■ 43.2
PABPC4Q13310 ANXA1-202ENST00000376911 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.522e-80■■■■■ 43.2
PABPC4Q13310 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.597e-12■■■■■ 43.2
PABPC4Q13310 MRPL13-202ENST00000518696 1418 ntTSL 1 (best)14.37□□□□□ -0.117e-12■■■■■ 43.2
PABPC4Q13310 MRPL13-205ENST00000521648 703 ntTSL 211.83□□□□□ -0.527e-12■■■■■ 43.2
PABPC4Q13310 MRPL13-206ENST00000522717 480 ntTSL 26.78□□□□□ -1.327e-12■■■■■ 43.2
PABPC4Q13310 MRPL13-207ENST00000613356 2367 ntTSL 24.5□□□□□ -1.697e-12■■■■■ 43.2
PABPC4Q13310 NSMCE1-201ENST00000361439 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.195e-7■■■■■ 43.2
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PABPC4Q13310 NSMCE1-208ENST00000565070 1853 ntTSL 514.48□□□□□ -0.095e-7■■■■■ 43.2
PABPC4Q13310 USP36-208ENST00000587379 606 ntTSL 311.74□□□□□ -0.531e-7■■■■■ 43.1
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PABPC4Q13310 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.143e-6■■■■■ 43.1
PABPC4Q13310 LLGL1-202ENST00000479155 6004 ntTSL 1 (best)15.88■□□□□ 0.133e-6■■■■■ 43.1
PABPC4Q13310 CEP350-202ENST00000367607 13491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.584e-9■■■■■ 43
PABPC4Q13310 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.45e-7■■■■■ 43
PABPC4Q13310 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.761e-6■■■■■ 42.9
PABPC4Q13310 ATOX1-201ENST00000313115 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.611e-6■■■■■ 42.9
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PABPC4Q13310 ATOX1-205ENST00000522314 724 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.661e-6■■■■■ 42.9
PABPC4Q13310 ATOX1-203ENST00000521264 4341 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.151e-6■■■■■ 42.9
PABPC4Q13310 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.418e-7■■■■■ 42.9
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PABPC4Q13310 MTHFD1-201ENST00000216605 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.833e-23■■■■■ 42.9
PABPC4Q13310 MTHFD1-206ENST00000554353 556 ntTSL 26.72□□□□□ -1.333e-23■■■■■ 42.9
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PABPC4Q13310 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.132e-7■■■■■ 42.9
PABPC4Q13310 PPP5C-205ENST00000478046 1886 ntTSL 1 (best)17.03■□□□□ 0.322e-7■■■■■ 42.9
PABPC4Q13310 PPP5C-207ENST00000487483 4675 ntTSL 516.61■□□□□ 0.252e-7■■■■■ 42.9
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PABPC4Q13310 GAGE1-203ENST00000610680 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.443e-7■■■■■ 42.8
PABPC4Q13310 AC007389.1-202ENST00000377977 1266 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.134e-13■■■■■ 42.8
PABPC4Q13310 AC007389.1-201ENST00000606978 1117 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.244e-13■■■■■ 42.8
PABPC4Q13310 CETN3-206ENST00000522864 738 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.264e-13■■■■■ 42.8
PABPC4Q13310 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.196e-8■■■■■ 42.7
PABPC4Q13310 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.778e-19■■■■■ 42.7
PABPC4Q13310 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.086e-10■■■■■ 42.7
PABPC4Q13310 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.786e-10■■■■■ 42.7
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PABPC4Q13310 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.446e-10■■■■■ 42.7
PABPC4Q13310 RPL28-201ENST00000344063 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.516e-10■■■■■ 42.7
PABPC4Q13310 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.081e-14■■■■■ 42.7
PABPC4Q13310 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.751e-14■■■■■ 42.7
PABPC4Q13310 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.221e-14■■■■■ 42.7
PABPC4Q13310 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.71e-14■■■■■ 42.7
PABPC4Q13310 COMT-201ENST00000207636 1319 ntTSL 518.23■□□□□ 0.511e-14■■■■■ 42.7
PABPC4Q13310 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.511e-14■■■■■ 42.7
PABPC4Q13310 RPL41-201ENST00000358888 551 ntTSL 312.38□□□□□ -0.435e-51■■■■■ 42.7
PABPC4Q13310 RPL41-204ENST00000546591 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.825e-51■■■■■ 42.7
PABPC4Q13310 RPL41-202ENST00000501597 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.045e-51■■■■■ 42.7
PABPC4Q13310 RPL41-203ENST00000546485 335 ntTSL 27.83□□□□□ -1.165e-51■■■■■ 42.7
PABPC4Q13310 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.899e-11■■■■■ 42.6
PABPC4Q13310 BRPF3-203ENST00000441123 5380 ntTSL 1 (best)14.05□□□□□ -0.169e-11■■■■■ 42.6
PABPC4Q13310 BRPF3-204ENST00000441730 3329 ntTSL 511.5□□□□□ -0.579e-11■■■■■ 42.6
PABPC4Q13310 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.546e-7■■■■■ 42.6
PABPC4Q13310 SYPL1-201ENST00000011473 2127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.145e-15■■■■■ 42.5
PABPC4Q13310 SYPL1-202ENST00000455385 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.425e-15■■■■■ 42.5
PABPC4Q13310 YY1-205ENST00000554804 1114 ntTSL 38.22□□□□□ -1.096e-7■■■■■ 42.5
PABPC4Q13310 LAMTOR4-202ENST00000441173 730 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.095e-9■■■■■ 42.5
PABPC4Q13310 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.451e-9■■■■■ 42.5
PABPC4Q13310 MRFAP1L1-202ENST00000500563 2127 nt15.68■□□□□ 0.15e-18■■■■■ 42.5
PABPC4Q13310 MRFAP1L1-201ENST00000320848 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.065e-18■■■■■ 42.5
PABPC4Q13310 CLIC4-201ENST00000374379 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.018e-11■■■■■ 42.4
PABPC4Q13310 CLIC4-202ENST00000488683 2723 ntTSL 214.03□□□□□ -0.168e-11■■■■■ 42.4
PABPC4Q13310 CELF1-203ENST00000361904 1580 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.394e-17■■■■■ 42.4
PABPC4Q13310 CELF1-205ENST00000395292 2191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.84e-17■■■■■ 42.4
PABPC4Q13310 CELF1-202ENST00000358597 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.844e-17■■■■■ 42.4
PABPC4Q13310 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.252e-14■■■■■ 42.3
PABPC4Q13310 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.212e-14■■■■■ 42.3
PABPC4Q13310 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.741e-6■■■■■ 42.3
PABPC4Q13310 KHK-206ENST00000490823 1396 ntTSL 522.72■■□□□ 1.231e-6■■■■■ 42.3
PABPC4Q13310 NDUFAF1-203ENST00000559127 1585 ntTSL 1 (best)21.38■■□□□ 1.011e-6■■■■■ 42.3
PABPC4Q13310 KHK-204ENST00000464371 1042 ntTSL 1 (best)19.15■□□□□ 0.661e-6■■■■■ 42.3
PABPC4Q13310 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.431e-6■■■■■ 42.3
Retrieved 100 of 23,669 protein–RNA pairs in 425.9 ms