Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC40.1■■■■■ 4.01
GRIN2AQ12879 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
GRIN2AQ12879 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
GRIN2AQ12879 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC40.09■■■■■ 4.01
GRIN2AQ12879 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC40.09■■■■■ 4.01
GRIN2AQ12879 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
GRIN2AQ12879 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
GRIN2AQ12879 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC40.08■■■■■ 4.01
GRIN2AQ12879 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4.01
GRIN2AQ12879 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC40.07■■■■■ 4.01
GRIN2AQ12879 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC40.07■■■■■ 4.01
GRIN2AQ12879 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC40.07■■■■■ 4.01
GRIN2AQ12879 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4.01
GRIN2AQ12879 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4.01
GRIN2AQ12879 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC40.06■■■■■ 4
GRIN2AQ12879 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC40.06■■■■■ 4
GRIN2AQ12879 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC40.06■■■■■ 4
GRIN2AQ12879 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC40.06■■■■■ 4
GRIN2AQ12879 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC40.06■■■■■ 4
GRIN2AQ12879 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC40.06■■■■■ 4
GRIN2AQ12879 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC40.05■■■■■ 4
GRIN2AQ12879 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
GRIN2AQ12879 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC40.04■■■■■ 4
GRIN2AQ12879 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC40.04■■■■■ 4
GRIN2AQ12879 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
GRIN2AQ12879 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
GRIN2AQ12879 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC40.04■■■■■ 4
GRIN2AQ12879 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC40.03■■■■■ 4
GRIN2AQ12879 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC40.03■■■■■ 4
GRIN2AQ12879 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
GRIN2AQ12879 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC40.02■■■■■ 4
GRIN2AQ12879 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC40.02■■■■■ 4
GRIN2AQ12879 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC40.01■■■■■ 4
GRIN2AQ12879 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC40.01■■■■□ 3.99
GRIN2AQ12879 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC40■■■■□ 3.99
GRIN2AQ12879 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC40■■■■□ 3.99
GRIN2AQ12879 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC40■■■■□ 3.99
GRIN2AQ12879 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC40■■■■□ 3.99
GRIN2AQ12879 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
GRIN2AQ12879 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC40■■■■□ 3.99
GRIN2AQ12879 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
GRIN2AQ12879 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
GRIN2AQ12879 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC39.99■■■■□ 3.99
GRIN2AQ12879 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
GRIN2AQ12879 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
GRIN2AQ12879 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.98■■■■□ 3.99
GRIN2AQ12879 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC39.98■■■■□ 3.99
GRIN2AQ12879 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
GRIN2AQ12879 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
GRIN2AQ12879 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC39.97■■■■□ 3.99
GRIN2AQ12879 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC39.97■■■■□ 3.99
GRIN2AQ12879 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
GRIN2AQ12879 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC39.96■■■■□ 3.99
GRIN2AQ12879 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC39.96■■■■□ 3.99
GRIN2AQ12879 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC39.96■■■■□ 3.99
GRIN2AQ12879 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC39.96■■■■□ 3.99
GRIN2AQ12879 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC39.96■■■■□ 3.99
GRIN2AQ12879 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
GRIN2AQ12879 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC39.95■■■■□ 3.99
GRIN2AQ12879 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC39.95■■■■□ 3.99
GRIN2AQ12879 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
GRIN2AQ12879 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
GRIN2AQ12879 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.94■■■■□ 3.99
GRIN2AQ12879 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC39.94■■■■□ 3.98
GRIN2AQ12879 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC39.94■■■■□ 3.98
GRIN2AQ12879 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
GRIN2AQ12879 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC39.94■■■■□ 3.98
GRIN2AQ12879 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC39.94■■■■□ 3.98
GRIN2AQ12879 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC39.93■■■■□ 3.98
GRIN2AQ12879 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC39.93■■■■□ 3.98
GRIN2AQ12879 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.93■■■■□ 3.98
GRIN2AQ12879 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC39.93■■■■□ 3.98
GRIN2AQ12879 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.92■■■■□ 3.98
GRIN2AQ12879 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC39.91■■■■□ 3.98
GRIN2AQ12879 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.91■■■■□ 3.98
GRIN2AQ12879 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
GRIN2AQ12879 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC39.91■■■■□ 3.98
GRIN2AQ12879 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
GRIN2AQ12879 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC39.9■■■■□ 3.98
GRIN2AQ12879 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.89■■■■□ 3.98
GRIN2AQ12879 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC39.89■■■■□ 3.98
GRIN2AQ12879 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.98
GRIN2AQ12879 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.98
GRIN2AQ12879 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC39.88■■■■□ 3.98
GRIN2AQ12879 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC39.88■■■■□ 3.98
GRIN2AQ12879 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.87■■■■□ 3.97
GRIN2AQ12879 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC39.87■■■■□ 3.97
GRIN2AQ12879 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC39.87■■■■□ 3.97
GRIN2AQ12879 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
GRIN2AQ12879 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC39.84■■■■□ 3.97
GRIN2AQ12879 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
GRIN2AQ12879 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC39.83■■■■□ 3.97
GRIN2AQ12879 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.97
GRIN2AQ12879 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC39.82■■■■□ 3.97
GRIN2AQ12879 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC39.82■■■■□ 3.97
GRIN2AQ12879 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC39.82■■■■□ 3.97
GRIN2AQ12879 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.96
GRIN2AQ12879 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.96
GRIN2AQ12879 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC39.82■■■■□ 3.96
GRIN2AQ12879 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC39.81■■■■□ 3.96
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