Protein–RNA interactions for Protein: Q12309

CLF1, Pre-mRNA-splicing factor CLF1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 687 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CLF1Q12309 YNL120CYNL120C 486 nt7.25□□□□□ -1.25
CLF1Q12309 YNR014WYNR014W 639 nt7.25□□□□□ -1.25
CLF1Q12309 ERG1YGR175C 1491 nt7.24□□□□□ -1.25
CLF1Q12309 PEX31YGR004W 1389 nt7.24□□□□□ -1.25
CLF1Q12309 CCT3YJL014W 1605 nt7.24□□□□□ -1.25
CLF1Q12309 NTG1YAL015C 1200 nt7.24□□□□□ -1.25
CLF1Q12309 YKR032WYKR032W 315 nt7.24□□□□□ -1.25
CLF1Q12309 AVO2YMR068W 1281 nt7.24□□□□□ -1.25
CLF1Q12309 TOS6YNL300W 309 nt7.24□□□□□ -1.25
CLF1Q12309 PTC4YBR125C 1182 nt7.24□□□□□ -1.25
CLF1Q12309 SGF29YCL010C 780 nt7.24□□□□□ -1.25
CLF1Q12309 YPR196WYPR196W 1413 nt7.24□□□□□ -1.25
CLF1Q12309 YJR107WYJR107W 987 nt7.23□□□□□ -1.25
CLF1Q12309 GTO3YMR251W 1101 nt7.23□□□□□ -1.25
CLF1Q12309 ADH5YBR145W 1056 nt7.23□□□□□ -1.25
CLF1Q12309 GPH1YPR160W 2709 nt7.23□□□□□ -1.25
CLF1Q12309 PEX3YDR329C 1326 nt7.23□□□□□ -1.25
CLF1Q12309 DSF1YEL070W 1509 nt7.22□□□□□ -1.25
CLF1Q12309 YNR073CYNR073C 1509 nt7.22□□□□□ -1.25
CLF1Q12309 YDL085C-AYDL085C-A 207 nt7.22□□□□□ -1.25
CLF1Q12309 TIM22YDL217C 624 nt7.22□□□□□ -1.25
CLF1Q12309 TPK1YJL164C 1194 nt7.22□□□□□ -1.25
CLF1Q12309 PSR2YLR019W 1194 nt7.22□□□□□ -1.25
CLF1Q12309 SRN2YLR119W 642 nt7.22□□□□□ -1.25
CLF1Q12309 FPR3YML074C 1236 nt7.22□□□□□ -1.25
CLF1Q12309 ECM31YBR176W 939 nt7.22□□□□□ -1.25
CLF1Q12309 HEM1YDR232W 1647 nt7.22□□□□□ -1.25
CLF1Q12309 YGR054WYGR054W 1929 nt7.21□□□□□ -1.25
CLF1Q12309 RIX7YLL034C 2514 nt7.21□□□□□ -1.26
CLF1Q12309 FZF1YGL254W 900 nt7.21□□□□□ -1.26
CLF1Q12309 VPS24YKL041W 675 nt7.21□□□□□ -1.26
CLF1Q12309 QRI5YLR204W 336 nt7.21□□□□□ -1.26
CLF1Q12309 YNL097W-AYNL097W-A 156 nt7.21□□□□□ -1.26
CLF1Q12309 COQ3YOL096C 939 nt7.21□□□□□ -1.26
CLF1Q12309 NHA1YLR138W 2958 nt7.21□□□□□ -1.26
CLF1Q12309 RVB2YPL235W 1416 nt7.2□□□□□ -1.26
CLF1Q12309 NSE5YML023C 1671 nt7.2□□□□□ -1.26
CLF1Q12309 NTE1YML059C 5040 nt7.2□□□□□ -1.26
CLF1Q12309 PRE3YJL001W 648 nt7.2□□□□□ -1.26
CLF1Q12309 TSR3YOR006C 942 nt7.2□□□□□ -1.26
CLF1Q12309 RPL5YPL131W 894 nt7.2□□□□□ -1.26
CLF1Q12309 GSH1YJL101C 2037 nt7.2□□□□□ -1.26
CLF1Q12309 EMP65YER140W 1671 nt7.19□□□□□ -1.26
CLF1Q12309 SDH4YDR178W 546 nt7.19□□□□□ -1.26
CLF1Q12309 MEH1YKR007W 555 nt7.19□□□□□ -1.26
CLF1Q12309 CCC2YDR270W 3015 nt7.19□□□□□ -1.26
CLF1Q12309 CHS5YLR330W 2016 nt7.18□□□□□ -1.26
CLF1Q12309 HXK2YGL253W 1461 nt7.18□□□□□ -1.26
CLF1Q12309 RAD59YDL059C 717 nt7.18□□□□□ -1.26
CLF1Q12309 FBA1YKL060C 1080 nt7.18□□□□□ -1.26
CLF1Q12309 MEU1YLR017W 1014 nt7.18□□□□□ -1.26
CLF1Q12309 GLC8YMR311C 690 nt7.18□□□□□ -1.26
CLF1Q12309 SMK1YPR054W 1167 nt7.18□□□□□ -1.26
CLF1Q12309 CRF1YDR223W 1404 nt7.18□□□□□ -1.26
CLF1Q12309 YLL066CYLL066C 3618 nt7.18□□□□□ -1.26
CLF1Q12309 SKY1YMR216C 2229 nt7.17□□□□□ -1.26
CLF1Q12309 HXT17YNR072W 1695 nt7.17□□□□□ -1.26
CLF1Q12309 DYS1YHR068W 1164 nt7.17□□□□□ -1.26
CLF1Q12309 RRN10YBL025W 438 nt7.17□□□□□ -1.26
CLF1Q12309 MSY1YPL097W 1479 nt7.17□□□□□ -1.26
CLF1Q12309 SQT1YIR012W 1296 nt7.16□□□□□ -1.26
CLF1Q12309 HMT1YBR034C 1047 nt7.16□□□□□ -1.26
CLF1Q12309 HIS7YBR248C 1659 nt7.16□□□□□ -1.26
CLF1Q12309 OST3YOR085W 1053 nt7.15□□□□□ -1.26
CLF1Q12309 RPS28AYOR167C 204 nt7.15□□□□□ -1.26
CLF1Q12309 EEB1YPL095C 1371 nt7.15□□□□□ -1.26
CLF1Q12309 THI2YBR240C 1353 nt7.15□□□□□ -1.26
CLF1Q12309 SLA2YNL243W 2907 nt7.15□□□□□ -1.27
CLF1Q12309 MED6YHR058C 888 nt7.14□□□□□ -1.27
CLF1Q12309 YHR213W-AYHR213W-A 234 nt7.14□□□□□ -1.27
CLF1Q12309 AIM24YJR080C 1185 nt7.14□□□□□ -1.27
CLF1Q12309 SPS22YCL048W 1392 nt7.14□□□□□ -1.27
CLF1Q12309 ORM1YGR038W 669 nt7.13□□□□□ -1.27
CLF1Q12309 RPP1YHR062C 882 nt7.13□□□□□ -1.27
CLF1Q12309 YJL211CYJL211C 444 nt7.13□□□□□ -1.27
CLF1Q12309 RPS3YNL178W 723 nt7.13□□□□□ -1.27
CLF1Q12309 HST2YPL015C 1074 nt7.13□□□□□ -1.27
CLF1Q12309 JIP4YDR475C 2631 nt7.12□□□□□ -1.27
CLF1Q12309 MOG1YJR074W 657 nt7.12□□□□□ -1.27
CLF1Q12309 YPL071CYPL071C 471 nt7.12□□□□□ -1.27
CLF1Q12309 TFC6YDR362C 2019 nt7.11□□□□□ -1.27
CLF1Q12309 TKL2YBR117C 2046 nt7.11□□□□□ -1.27
CLF1Q12309 RSP5YER125W 2430 nt7.11□□□□□ -1.27
CLF1Q12309 YDR015CYDR015C 240 nt7.11□□□□□ -1.27
CLF1Q12309 YIR018C-AYIR018C-A 138 nt7.11□□□□□ -1.27
CLF1Q12309 TIF2YJL138C 1188 nt7.11□□□□□ -1.27
CLF1Q12309 TIF1YKR059W 1188 nt7.11□□□□□ -1.27
CLF1Q12309 LDB19YOR322C 2457 nt7.11□□□□□ -1.27
CLF1Q12309 HXT2YMR011W 1626 nt7.11□□□□□ -1.27
CLF1Q12309 OPT1YJL212C 2400 nt7.11□□□□□ -1.27
CLF1Q12309 POP1YNL221C 2628 nt7.11□□□□□ -1.27
CLF1Q12309 NOG2YNR053C 1461 nt7.11□□□□□ -1.27
CLF1Q12309 YDL218WYDL218W 954 nt7.1□□□□□ -1.27
CLF1Q12309 YDR401WYDR401W 564 nt7.1□□□□□ -1.27
CLF1Q12309 HEM2YGL040C 1029 nt7.1□□□□□ -1.27
CLF1Q12309 YHL018WYHL018W 363 nt7.1□□□□□ -1.27
CLF1Q12309 CMR1YDL156W 1569 nt7.1□□□□□ -1.27
CLF1Q12309 EMW1YNL313C 2715 nt7.1□□□□□ -1.27
CLF1Q12309 CYC8YBR112C 2901 nt7.1□□□□□ -1.27
CLF1Q12309 IVY1YDR229W 1362 nt7.09□□□□□ -1.27
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