Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Atp2b3Q0VF55 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Atp2b3Q0VF55 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Atp2b3Q0VF55 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Atp2b3Q0VF55 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Atp2b3Q0VF55 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Atp2b3Q0VF55 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Atp2b3Q0VF55 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Atp2b3Q0VF55 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Atp2b3Q0VF55 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Atp2b3Q0VF55 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Atp2b3Q0VF55 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Atp2b3Q0VF55 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Atp2b3Q0VF55 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Atp2b3Q0VF55 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Atp2b3Q0VF55 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Atp2b3Q0VF55 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Atp2b3Q0VF55 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Atp2b3Q0VF55 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Atp2b3Q0VF55 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Atp2b3Q0VF55 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Atp2b3Q0VF55 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Atp2b3Q0VF55 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Atp2b3Q0VF55 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Atp2b3Q0VF55 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Atp2b3Q0VF55 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Atp2b3Q0VF55 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Atp2b3Q0VF55 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Atp2b3Q0VF55 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Atp2b3Q0VF55 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Atp2b3Q0VF55 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Atp2b3Q0VF55 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Atp2b3Q0VF55 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Atp2b3Q0VF55 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Atp2b3Q0VF55 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Atp2b3Q0VF55 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Atp2b3Q0VF55 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Atp2b3Q0VF55 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Atp2b3Q0VF55 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Atp2b3Q0VF55 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Atp2b3Q0VF55 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Atp2b3Q0VF55 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Atp2b3Q0VF55 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Atp2b3Q0VF55 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Atp2b3Q0VF55 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Atp2b3Q0VF55 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Atp2b3Q0VF55 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Atp2b3Q0VF55 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Atp2b3Q0VF55 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Atp2b3Q0VF55 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Atp2b3Q0VF55 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Atp2b3Q0VF55 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Atp2b3Q0VF55 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Atp2b3Q0VF55 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Atp2b3Q0VF55 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Atp2b3Q0VF55 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Atp2b3Q0VF55 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Atp2b3Q0VF55 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Atp2b3Q0VF55 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Atp2b3Q0VF55 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Atp2b3Q0VF55 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Atp2b3Q0VF55 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Atp2b3Q0VF55 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Atp2b3Q0VF55 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Atp2b3Q0VF55 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Atp2b3Q0VF55 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Atp2b3Q0VF55 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Atp2b3Q0VF55 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Atp2b3Q0VF55 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Atp2b3Q0VF55 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Atp2b3Q0VF55 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Atp2b3Q0VF55 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Atp2b3Q0VF55 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Atp2b3Q0VF55 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Atp2b3Q0VF55 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Atp2b3Q0VF55 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Atp2b3Q0VF55 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Atp2b3Q0VF55 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Atp2b3Q0VF55 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Atp2b3Q0VF55 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Atp2b3Q0VF55 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Atp2b3Q0VF55 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Atp2b3Q0VF55 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Atp2b3Q0VF55 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Atp2b3Q0VF55 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Atp2b3Q0VF55 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Atp2b3Q0VF55 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Atp2b3Q0VF55 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Atp2b3Q0VF55 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Atp2b3Q0VF55 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Atp2b3Q0VF55 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Atp2b3Q0VF55 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Atp2b3Q0VF55 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Atp2b3Q0VF55 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Atp2b3Q0VF55 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Atp2b3Q0VF55 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Atp2b3Q0VF55 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Atp2b3Q0VF55 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Atp2b3Q0VF55 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Atp2b3Q0VF55 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms