Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBL6

Hif3a, Hypoxia-inducible factor 3-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hif3aQ0VBL6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hif3aQ0VBL6 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hif3aQ0VBL6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hif3aQ0VBL6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hif3aQ0VBL6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hif3aQ0VBL6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hif3aQ0VBL6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hif3aQ0VBL6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hif3aQ0VBL6 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Hif3aQ0VBL6 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hif3aQ0VBL6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hif3aQ0VBL6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hif3aQ0VBL6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hif3aQ0VBL6 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hif3aQ0VBL6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hif3aQ0VBL6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hif3aQ0VBL6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hif3aQ0VBL6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hif3aQ0VBL6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hif3aQ0VBL6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Hif3aQ0VBL6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hif3aQ0VBL6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hif3aQ0VBL6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hif3aQ0VBL6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hif3aQ0VBL6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hif3aQ0VBL6 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hif3aQ0VBL6 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Hif3aQ0VBL6 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hif3aQ0VBL6 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Hif3aQ0VBL6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hif3aQ0VBL6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hif3aQ0VBL6 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Hif3aQ0VBL6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hif3aQ0VBL6 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hif3aQ0VBL6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hif3aQ0VBL6 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hif3aQ0VBL6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hif3aQ0VBL6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hif3aQ0VBL6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hif3aQ0VBL6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hif3aQ0VBL6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hif3aQ0VBL6 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hif3aQ0VBL6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hif3aQ0VBL6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hif3aQ0VBL6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hif3aQ0VBL6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hif3aQ0VBL6 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hif3aQ0VBL6 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Hif3aQ0VBL6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hif3aQ0VBL6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hif3aQ0VBL6 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hif3aQ0VBL6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hif3aQ0VBL6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hif3aQ0VBL6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hif3aQ0VBL6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hif3aQ0VBL6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hif3aQ0VBL6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hif3aQ0VBL6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hif3aQ0VBL6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hif3aQ0VBL6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hif3aQ0VBL6 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hif3aQ0VBL6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hif3aQ0VBL6 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hif3aQ0VBL6 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hif3aQ0VBL6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hif3aQ0VBL6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hif3aQ0VBL6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hif3aQ0VBL6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hif3aQ0VBL6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hif3aQ0VBL6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hif3aQ0VBL6 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hif3aQ0VBL6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Hif3aQ0VBL6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hif3aQ0VBL6 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hif3aQ0VBL6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hif3aQ0VBL6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hif3aQ0VBL6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hif3aQ0VBL6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hif3aQ0VBL6 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hif3aQ0VBL6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hif3aQ0VBL6 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hif3aQ0VBL6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hif3aQ0VBL6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hif3aQ0VBL6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Hif3aQ0VBL6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Hif3aQ0VBL6 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Hif3aQ0VBL6 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hif3aQ0VBL6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hif3aQ0VBL6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hif3aQ0VBL6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hif3aQ0VBL6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hif3aQ0VBL6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Hif3aQ0VBL6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hif3aQ0VBL6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Hif3aQ0VBL6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hif3aQ0VBL6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Hif3aQ0VBL6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Hif3aQ0VBL6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hif3aQ0VBL6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Hif3aQ0VBL6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94 ms