Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF8

Stum, Protein stum homolog, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StumQ0VBF8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
StumQ0VBF8 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
StumQ0VBF8 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
StumQ0VBF8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
StumQ0VBF8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
StumQ0VBF8 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
StumQ0VBF8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
StumQ0VBF8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
StumQ0VBF8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
StumQ0VBF8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
StumQ0VBF8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
StumQ0VBF8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
StumQ0VBF8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
StumQ0VBF8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
StumQ0VBF8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
StumQ0VBF8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
StumQ0VBF8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
StumQ0VBF8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
StumQ0VBF8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
StumQ0VBF8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
StumQ0VBF8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
StumQ0VBF8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
StumQ0VBF8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
StumQ0VBF8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
StumQ0VBF8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
StumQ0VBF8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
StumQ0VBF8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
StumQ0VBF8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
StumQ0VBF8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
StumQ0VBF8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
StumQ0VBF8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
StumQ0VBF8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
StumQ0VBF8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
StumQ0VBF8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
StumQ0VBF8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
StumQ0VBF8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
StumQ0VBF8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
StumQ0VBF8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
StumQ0VBF8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
StumQ0VBF8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
StumQ0VBF8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
StumQ0VBF8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
StumQ0VBF8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
StumQ0VBF8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
StumQ0VBF8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
StumQ0VBF8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
StumQ0VBF8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
StumQ0VBF8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
StumQ0VBF8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
StumQ0VBF8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
StumQ0VBF8 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
StumQ0VBF8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
StumQ0VBF8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
StumQ0VBF8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
StumQ0VBF8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
StumQ0VBF8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
StumQ0VBF8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
StumQ0VBF8 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
StumQ0VBF8 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
StumQ0VBF8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
StumQ0VBF8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
StumQ0VBF8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
StumQ0VBF8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
StumQ0VBF8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
StumQ0VBF8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
StumQ0VBF8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
StumQ0VBF8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
StumQ0VBF8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
StumQ0VBF8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
StumQ0VBF8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
StumQ0VBF8 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
StumQ0VBF8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
StumQ0VBF8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
StumQ0VBF8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
StumQ0VBF8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
StumQ0VBF8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
StumQ0VBF8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
StumQ0VBF8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
StumQ0VBF8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
StumQ0VBF8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
StumQ0VBF8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
StumQ0VBF8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
StumQ0VBF8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
StumQ0VBF8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
StumQ0VBF8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
StumQ0VBF8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
StumQ0VBF8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
StumQ0VBF8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
StumQ0VBF8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
StumQ0VBF8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
StumQ0VBF8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
StumQ0VBF8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
StumQ0VBF8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
StumQ0VBF8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
StumQ0VBF8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
StumQ0VBF8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
StumQ0VBF8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
StumQ0VBF8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
StumQ0VBF8 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
StumQ0VBF8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.3 ms