Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAK6

LMOD3, Leiomodin-3, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD3Q0VAK6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
LMOD3Q0VAK6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
LMOD3Q0VAK6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
LMOD3Q0VAK6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
LMOD3Q0VAK6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
LMOD3Q0VAK6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
LMOD3Q0VAK6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
LMOD3Q0VAK6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
LMOD3Q0VAK6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
LMOD3Q0VAK6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
LMOD3Q0VAK6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
LMOD3Q0VAK6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
LMOD3Q0VAK6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC31.7■■■□□ 2.67
LMOD3Q0VAK6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
LMOD3Q0VAK6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
LMOD3Q0VAK6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
LMOD3Q0VAK6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
LMOD3Q0VAK6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
LMOD3Q0VAK6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
LMOD3Q0VAK6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
LMOD3Q0VAK6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC31.69■■■□□ 2.66
LMOD3Q0VAK6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
LMOD3Q0VAK6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
LMOD3Q0VAK6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
LMOD3Q0VAK6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
LMOD3Q0VAK6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
LMOD3Q0VAK6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
LMOD3Q0VAK6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
LMOD3Q0VAK6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
LMOD3Q0VAK6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
LMOD3Q0VAK6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
LMOD3Q0VAK6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
LMOD3Q0VAK6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
LMOD3Q0VAK6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
LMOD3Q0VAK6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
LMOD3Q0VAK6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
LMOD3Q0VAK6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
LMOD3Q0VAK6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
LMOD3Q0VAK6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
LMOD3Q0VAK6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
LMOD3Q0VAK6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
LMOD3Q0VAK6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
LMOD3Q0VAK6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
LMOD3Q0VAK6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
LMOD3Q0VAK6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
LMOD3Q0VAK6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
LMOD3Q0VAK6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
LMOD3Q0VAK6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
LMOD3Q0VAK6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
LMOD3Q0VAK6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
LMOD3Q0VAK6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
LMOD3Q0VAK6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
LMOD3Q0VAK6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
LMOD3Q0VAK6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
LMOD3Q0VAK6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
LMOD3Q0VAK6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.63■■■□□ 2.65
LMOD3Q0VAK6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
LMOD3Q0VAK6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
LMOD3Q0VAK6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
LMOD3Q0VAK6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
LMOD3Q0VAK6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
LMOD3Q0VAK6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
LMOD3Q0VAK6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
LMOD3Q0VAK6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
LMOD3Q0VAK6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
LMOD3Q0VAK6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
LMOD3Q0VAK6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
LMOD3Q0VAK6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
LMOD3Q0VAK6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
LMOD3Q0VAK6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
LMOD3Q0VAK6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
LMOD3Q0VAK6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
LMOD3Q0VAK6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
LMOD3Q0VAK6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
LMOD3Q0VAK6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
LMOD3Q0VAK6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
LMOD3Q0VAK6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
LMOD3Q0VAK6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
LMOD3Q0VAK6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
LMOD3Q0VAK6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
LMOD3Q0VAK6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
LMOD3Q0VAK6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
LMOD3Q0VAK6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
LMOD3Q0VAK6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
LMOD3Q0VAK6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
LMOD3Q0VAK6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
LMOD3Q0VAK6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC31.58■■■□□ 2.65
LMOD3Q0VAK6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
LMOD3Q0VAK6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
LMOD3Q0VAK6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
LMOD3Q0VAK6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
LMOD3Q0VAK6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
LMOD3Q0VAK6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
LMOD3Q0VAK6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
LMOD3Q0VAK6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
LMOD3Q0VAK6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
LMOD3Q0VAK6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
LMOD3Q0VAK6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
LMOD3Q0VAK6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
LMOD3Q0VAK6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 520.1 ms