Protein–RNA interactions for Protein: Q0P678

Zc3h18, Zinc finger CCCH domain-containing protein 18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 948 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h18Q0P678 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Zc3h18Q0P678 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Zc3h18Q0P678 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Zc3h18Q0P678 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Zc3h18Q0P678 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Zc3h18Q0P678 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Zc3h18Q0P678 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Zc3h18Q0P678 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Zc3h18Q0P678 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Zc3h18Q0P678 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Zc3h18Q0P678 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Zc3h18Q0P678 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Zc3h18Q0P678 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Zc3h18Q0P678 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Zc3h18Q0P678 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Zc3h18Q0P678 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Zc3h18Q0P678 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Zc3h18Q0P678 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Zc3h18Q0P678 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Zc3h18Q0P678 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Zc3h18Q0P678 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Zc3h18Q0P678 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Zc3h18Q0P678 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Zc3h18Q0P678 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Zc3h18Q0P678 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Zc3h18Q0P678 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Zc3h18Q0P678 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Zc3h18Q0P678 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Zc3h18Q0P678 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Zc3h18Q0P678 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Zc3h18Q0P678 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Zc3h18Q0P678 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Zc3h18Q0P678 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Zc3h18Q0P678 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Zc3h18Q0P678 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Zc3h18Q0P678 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Zc3h18Q0P678 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Zc3h18Q0P678 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Zc3h18Q0P678 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Zc3h18Q0P678 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Zc3h18Q0P678 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Zc3h18Q0P678 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Zc3h18Q0P678 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Zc3h18Q0P678 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Zc3h18Q0P678 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Zc3h18Q0P678 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Zc3h18Q0P678 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Zc3h18Q0P678 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Zc3h18Q0P678 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Zc3h18Q0P678 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Zc3h18Q0P678 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Zc3h18Q0P678 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Zc3h18Q0P678 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Zc3h18Q0P678 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Zc3h18Q0P678 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Zc3h18Q0P678 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Zc3h18Q0P678 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Zc3h18Q0P678 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Zc3h18Q0P678 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Zc3h18Q0P678 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Zc3h18Q0P678 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Zc3h18Q0P678 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Zc3h18Q0P678 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Zc3h18Q0P678 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Zc3h18Q0P678 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Zc3h18Q0P678 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Zc3h18Q0P678 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Zc3h18Q0P678 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Zc3h18Q0P678 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Zc3h18Q0P678 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Zc3h18Q0P678 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Zc3h18Q0P678 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Zc3h18Q0P678 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Zc3h18Q0P678 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Zc3h18Q0P678 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Zc3h18Q0P678 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Zc3h18Q0P678 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Zc3h18Q0P678 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Zc3h18Q0P678 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Zc3h18Q0P678 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Zc3h18Q0P678 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Zc3h18Q0P678 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Zc3h18Q0P678 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Zc3h18Q0P678 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zc3h18Q0P678 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zc3h18Q0P678 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zc3h18Q0P678 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zc3h18Q0P678 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zc3h18Q0P678 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zc3h18Q0P678 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zc3h18Q0P678 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zc3h18Q0P678 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Zc3h18Q0P678 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Zc3h18Q0P678 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Zc3h18Q0P678 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Zc3h18Q0P678 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Zc3h18Q0P678 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Zc3h18Q0P678 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Zc3h18Q0P678 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Zc3h18Q0P678 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms