Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RBBP4Q09028 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RBBP4Q09028 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RBBP4Q09028 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RBBP4Q09028 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RBBP4Q09028 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RBBP4Q09028 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RBBP4Q09028 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBBP4Q09028 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBBP4Q09028 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBBP4Q09028 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBBP4Q09028 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RBBP4Q09028 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RBBP4Q09028 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RBBP4Q09028 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RBBP4Q09028 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RBBP4Q09028 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RBBP4Q09028 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RBBP4Q09028 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RBBP4Q09028 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RBBP4Q09028 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RBBP4Q09028 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RBBP4Q09028 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RBBP4Q09028 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RBBP4Q09028 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RBBP4Q09028 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RBBP4Q09028 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RBBP4Q09028 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RBBP4Q09028 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RBBP4Q09028 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RBBP4Q09028 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RBBP4Q09028 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RBBP4Q09028 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RBBP4Q09028 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RBBP4Q09028 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RBBP4Q09028 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RBBP4Q09028 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RBBP4Q09028 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RBBP4Q09028 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RBBP4Q09028 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RBBP4Q09028 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RBBP4Q09028 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RBBP4Q09028 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RBBP4Q09028 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RBBP4Q09028 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RBBP4Q09028 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RBBP4Q09028 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RBBP4Q09028 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RBBP4Q09028 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RBBP4Q09028 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RBBP4Q09028 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RBBP4Q09028 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBBP4Q09028 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBBP4Q09028 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBBP4Q09028 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBBP4Q09028 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBBP4Q09028 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBBP4Q09028 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RBBP4Q09028 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBBP4Q09028 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBBP4Q09028 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBBP4Q09028 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBBP4Q09028 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBBP4Q09028 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBBP4Q09028 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBBP4Q09028 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBBP4Q09028 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBBP4Q09028 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBBP4Q09028 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBBP4Q09028 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBBP4Q09028 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBBP4Q09028 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBBP4Q09028 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBBP4Q09028 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBBP4Q09028 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RBBP4Q09028 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RBBP4Q09028 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RBBP4Q09028 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RBBP4Q09028 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RBBP4Q09028 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RBBP4Q09028 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RBBP4Q09028 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RBBP4Q09028 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RBBP4Q09028 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RBBP4Q09028 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RBBP4Q09028 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RBBP4Q09028 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RBBP4Q09028 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RBBP4Q09028 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RBBP4Q09028 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RBBP4Q09028 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RBBP4Q09028 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RBBP4Q09028 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RBBP4Q09028 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RBBP4Q09028 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RBBP4Q09028 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RBBP4Q09028 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RBBP4Q09028 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RBBP4Q09028 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RBBP4Q09028 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms