Protein–RNA interactions for Protein: Q08AE8

SPIRE1, Protein spire homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIRE1Q08AE8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SPIRE1Q08AE8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SPIRE1Q08AE8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
SPIRE1Q08AE8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SPIRE1Q08AE8 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SPIRE1Q08AE8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SPIRE1Q08AE8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SPIRE1Q08AE8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SPIRE1Q08AE8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SPIRE1Q08AE8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SPIRE1Q08AE8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SPIRE1Q08AE8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SPIRE1Q08AE8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SPIRE1Q08AE8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
SPIRE1Q08AE8 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SPIRE1Q08AE8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SPIRE1Q08AE8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SPIRE1Q08AE8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SPIRE1Q08AE8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SPIRE1Q08AE8 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SPIRE1Q08AE8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SPIRE1Q08AE8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SPIRE1Q08AE8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SPIRE1Q08AE8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SPIRE1Q08AE8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SPIRE1Q08AE8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SPIRE1Q08AE8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SPIRE1Q08AE8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SPIRE1Q08AE8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SPIRE1Q08AE8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SPIRE1Q08AE8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SPIRE1Q08AE8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SPIRE1Q08AE8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SPIRE1Q08AE8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SPIRE1Q08AE8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SPIRE1Q08AE8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SPIRE1Q08AE8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SPIRE1Q08AE8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SPIRE1Q08AE8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SPIRE1Q08AE8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SPIRE1Q08AE8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SPIRE1Q08AE8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SPIRE1Q08AE8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SPIRE1Q08AE8 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SPIRE1Q08AE8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SPIRE1Q08AE8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SPIRE1Q08AE8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SPIRE1Q08AE8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SPIRE1Q08AE8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SPIRE1Q08AE8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SPIRE1Q08AE8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SPIRE1Q08AE8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SPIRE1Q08AE8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SPIRE1Q08AE8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
SPIRE1Q08AE8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
SPIRE1Q08AE8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SPIRE1Q08AE8 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SPIRE1Q08AE8 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SPIRE1Q08AE8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SPIRE1Q08AE8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SPIRE1Q08AE8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SPIRE1Q08AE8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SPIRE1Q08AE8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SPIRE1Q08AE8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SPIRE1Q08AE8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SPIRE1Q08AE8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SPIRE1Q08AE8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SPIRE1Q08AE8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SPIRE1Q08AE8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SPIRE1Q08AE8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SPIRE1Q08AE8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SPIRE1Q08AE8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SPIRE1Q08AE8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SPIRE1Q08AE8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SPIRE1Q08AE8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SPIRE1Q08AE8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SPIRE1Q08AE8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SPIRE1Q08AE8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SPIRE1Q08AE8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SPIRE1Q08AE8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SPIRE1Q08AE8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SPIRE1Q08AE8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SPIRE1Q08AE8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SPIRE1Q08AE8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SPIRE1Q08AE8 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
SPIRE1Q08AE8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SPIRE1Q08AE8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SPIRE1Q08AE8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SPIRE1Q08AE8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SPIRE1Q08AE8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SPIRE1Q08AE8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SPIRE1Q08AE8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SPIRE1Q08AE8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SPIRE1Q08AE8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SPIRE1Q08AE8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SPIRE1Q08AE8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SPIRE1Q08AE8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SPIRE1Q08AE8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SPIRE1Q08AE8 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SPIRE1Q08AE8 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.1 ms