Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cntn3Q07409 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cntn3Q07409 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cntn3Q07409 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cntn3Q07409 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cntn3Q07409 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cntn3Q07409 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cntn3Q07409 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cntn3Q07409 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cntn3Q07409 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cntn3Q07409 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cntn3Q07409 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cntn3Q07409 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cntn3Q07409 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cntn3Q07409 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Cntn3Q07409 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cntn3Q07409 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cntn3Q07409 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cntn3Q07409 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cntn3Q07409 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cntn3Q07409 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cntn3Q07409 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cntn3Q07409 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cntn3Q07409 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cntn3Q07409 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cntn3Q07409 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Cntn3Q07409 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cntn3Q07409 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cntn3Q07409 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cntn3Q07409 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cntn3Q07409 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cntn3Q07409 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cntn3Q07409 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cntn3Q07409 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cntn3Q07409 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cntn3Q07409 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cntn3Q07409 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cntn3Q07409 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cntn3Q07409 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cntn3Q07409 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cntn3Q07409 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cntn3Q07409 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cntn3Q07409 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cntn3Q07409 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cntn3Q07409 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cntn3Q07409 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cntn3Q07409 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cntn3Q07409 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cntn3Q07409 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cntn3Q07409 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cntn3Q07409 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cntn3Q07409 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cntn3Q07409 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cntn3Q07409 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cntn3Q07409 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cntn3Q07409 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cntn3Q07409 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cntn3Q07409 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cntn3Q07409 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cntn3Q07409 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cntn3Q07409 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Cntn3Q07409 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Cntn3Q07409 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cntn3Q07409 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cntn3Q07409 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Cntn3Q07409 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cntn3Q07409 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cntn3Q07409 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cntn3Q07409 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cntn3Q07409 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cntn3Q07409 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Cntn3Q07409 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cntn3Q07409 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cntn3Q07409 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cntn3Q07409 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cntn3Q07409 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cntn3Q07409 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cntn3Q07409 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cntn3Q07409 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cntn3Q07409 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cntn3Q07409 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cntn3Q07409 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cntn3Q07409 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cntn3Q07409 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cntn3Q07409 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cntn3Q07409 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cntn3Q07409 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cntn3Q07409 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cntn3Q07409 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cntn3Q07409 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cntn3Q07409 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cntn3Q07409 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cntn3Q07409 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cntn3Q07409 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cntn3Q07409 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cntn3Q07409 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cntn3Q07409 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cntn3Q07409 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cntn3Q07409 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cntn3Q07409 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 166.9 ms