Protein–RNA interactions for Protein: Q06106

MRD1, Multiple RNA-binding domain-containing protein 1, yeast

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MRD1	Q06106	HSP12	YFL014W	330 nt		7.21	□□□□□ -1.26
MRD1	Q06106	CTF8	YHR191C	402 nt		7.21	□□□□□ -1.26
MRD1	Q06106	OPI8	YKR035C	642 nt		7.21	□□□□□ -1.26
MRD1	Q06106	VMA2	YBR127C	1554 nt		7.2	□□□□□ -1.26
MRD1	Q06106	MAK31	YCR020C-A	267 nt		7.2	□□□□□ -1.26
MRD1	Q06106	YDL218W	YDL218W	954 nt		7.2	□□□□□ -1.26
MRD1	Q06106	YDR015C	YDR015C	240 nt		7.2	□□□□□ -1.26
MRD1	Q06106	TPK1	YJL164C	1194 nt		7.2	□□□□□ -1.26
MRD1	Q06106	HMS2	YJR147W	1077 nt		7.2	□□□□□ -1.26
MRD1	Q06106	YNL285W	YNL285W	372 nt		7.2	□□□□□ -1.26
MRD1	Q06106	RGT2	YDL138W	2292 nt		7.2	□□□□□ -1.26
MRD1	Q06106	SKY1	YMR216C	2229 nt		7.19	□□□□□ -1.26
MRD1	Q06106	SUF5	tG(CCC)O	72 nt		7.19	□□□□□ -1.26
MRD1	Q06106	RPP1	YHR062C	882 nt		7.19	□□□□□ -1.26
MRD1	Q06106	YLR312C	YLR312C	1197 nt		7.19	□□□□□ -1.26
MRD1	Q06106	SUR7	YML052W	909 nt		7.19	□□□□□ -1.26
MRD1	Q06106	RKI1	YOR095C	777 nt		7.19	□□□□□ -1.26
MRD1	Q06106	ECM38	YLR299W	1983 nt		7.19	□□□□□ -1.26
MRD1	Q06106	RIX7	YLL034C	2514 nt		7.18	□□□□□ -1.26
MRD1	Q06106	ERP2	YAL007C	648 nt		7.18	□□□□□ -1.26
MRD1	Q06106	BDF2	YDL070W	1917 nt		7.18	□□□□□ -1.26
MRD1	Q06106	ARP3	YJR065C	1350 nt		7.18	□□□□□ -1.26
MRD1	Q06106	POX1	YGL205W	2247 nt		7.17	□□□□□ -1.26
MRD1	Q06106	ECM14	YHR132C	1293 nt		7.17	□□□□□ -1.26
MRD1	Q06106	DOT5	YIL010W	648 nt		7.17	□□□□□ -1.26
MRD1	Q06106	LCB3	YJL134W	1230 nt		7.17	□□□□□ -1.26
MRD1	Q06106	YLR123C	YLR123C	330 nt		7.17	□□□□□ -1.26
MRD1	Q06106	YET3	YDL072C	612 nt		7.16	□□□□□ -1.26
MRD1	Q06106	BIM1	YER016W	1035 nt		7.16	□□□□□ -1.26
MRD1	Q06106	UIP4	YPL186C	915 nt		7.16	□□□□□ -1.26
MRD1	Q06106	GPA1	YHR005C	1419 nt		7.16	□□□□□ -1.26
MRD1	Q06106	COG1	YGL223C	1254 nt		7.15	□□□□□ -1.26
MRD1	Q06106	CCC2	YDR270W	3015 nt		7.15	□□□□□ -1.27
MRD1	Q06106	YKR023W	YKR023W	1593 nt		7.15	□□□□□ -1.27
MRD1	Q06106	FRE5	YOR384W	2085 nt		7.15	□□□□□ -1.27
MRD1	Q06106	MCH1	YDL054C	1461 nt		7.14	□□□□□ -1.27
MRD1	Q06106	BUD32	YGR262C	786 nt		7.14	□□□□□ -1.27
MRD1	Q06106	PEX13	YLR191W	1161 nt		7.14	□□□□□ -1.27
MRD1	Q06106	KTR1	YOR099W	1182 nt		7.14	□□□□□ -1.27
MRD1	Q06106	ATG22	YCL038C	1587 nt		7.14	□□□□□ -1.27
MRD1	Q06106	ILV1	YER086W	1731 nt		7.13	□□□□□ -1.27
MRD1	Q06106	ICL1	YER065C	1674 nt		7.13	□□□□□ -1.27
MRD1	Q06106	AIM3	YBR108W	2844 nt		7.13	□□□□□ -1.27
MRD1	Q06106	FAF1	YIL019W	1041 nt		7.13	□□□□□ -1.27
MRD1	Q06106	QCR8	YJL166W	285 nt		7.13	□□□□□ -1.27
MRD1	Q06106	UTR2	YEL040W	1404 nt		7.12	□□□□□ -1.27
MRD1	Q06106	CAF40	YNL288W	1122 nt		7.12	□□□□□ -1.27
MRD1	Q06106	CLN1	YMR199W	1641 nt		7.12	□□□□□ -1.27
MRD1	Q06106	RSP5	YER125W	2430 nt		7.11	□□□□□ -1.27
MRD1	Q06106	TIF2	YJL138C	1188 nt		7.1	□□□□□ -1.27
MRD1	Q06106	POP5	YAL033W	522 nt		7.1	□□□□□ -1.27
MRD1	Q06106	RPS5	YJR123W	678 nt		7.1	□□□□□ -1.27
MRD1	Q06106	TIF1	YKR059W	1188 nt		7.1	□□□□□ -1.27
MRD1	Q06106	COX5A	YNL052W	462 nt		7.1	□□□□□ -1.27
MRD1	Q06106	IES2	YNL215W	963 nt		7.1	□□□□□ -1.27
MRD1	Q06106	YPR204W	YPR204W	3099 nt		7.1	□□□□□ -1.27
MRD1	Q06106	SIT4	YDL047W	936 nt		7.09	□□□□□ -1.27
MRD1	Q06106	GCV3	YAL044C	513 nt		7.09	□□□□□ -1.27
MRD1	Q06106	JNM1	YMR294W	1122 nt		7.09	□□□□□ -1.27
MRD1	Q06106	IDP3	YNL009W	1263 nt		7.09	□□□□□ -1.27
MRD1	Q06106	SKS1	YPL026C	1509 nt		7.09	□□□□□ -1.27
MRD1	Q06106	TKL2	YBR117C	2046 nt		7.09	□□□□□ -1.27
MRD1	Q06106	NOG2	YNR053C	1461 nt		7.09	□□□□□ -1.27
MRD1	Q06106	EXG1	YLR300W	1347 nt		7.08	□□□□□ -1.28
MRD1	Q06106	SEN34	YAR008W	828 nt		7.08	□□□□□ -1.28
MRD1	Q06106	YOR200W	YOR200W	399 nt		7.08	□□□□□ -1.28
MRD1	Q06106	YMC1	YPR058W	924 nt		7.08	□□□□□ -1.28
MRD1	Q06106	YPR160C-A	YPR160C-A	285 nt		7.08	□□□□□ -1.28
MRD1	Q06106	YML133C	YML133C	4125 nt		7.08	□□□□□ -1.28
MRD1	Q06106	LDS1	YAL018C	978 nt		7.07	□□□□□ -1.28
MRD1	Q06106	ENV7	YPL236C	1095 nt		7.07	□□□□□ -1.28
MRD1	Q06106	SES1	YDR023W	1389 nt		7.07	□□□□□ -1.28
MRD1	Q06106	FPR2	YDR519W	408 nt		7.06	□□□□□ -1.28
MRD1	Q06106	GTT3	YEL017W	1014 nt		7.06	□□□□□ -1.28
MRD1	Q06106	AIM33	YML087C	939 nt		7.06	□□□□□ -1.28
MRD1	Q06106	YBR284W	YBR284W	2394 nt		7.06	□□□□□ -1.28
MRD1	Q06106	PDR18	YNR070W	4002 nt		7.05	□□□□□ -1.28
MRD1	Q06106	ECM19	YLR390W	339 nt		7.05	□□□□□ -1.28
MRD1	Q06106	SGV1	YPR161C	1974 nt		7.05	□□□□□ -1.28
MRD1	Q06106	PYC2	YBR218C	3543 nt		7.04	□□□□□ -1.28
MRD1	Q06106	SLX5	YDL013W	1860 nt		7.04	□□□□□ -1.28
MRD1	Q06106	GPA2	YER020W	1350 nt		7.04	□□□□□ -1.28
MRD1	Q06106	HXT2	YMR011W	1626 nt		7.04	□□□□□ -1.28
MRD1	Q06106	NHA1	YLR138W	2958 nt		7.03	□□□□□ -1.28
MRD1	Q06106	PHO3	YBR092C	1404 nt		7.03	□□□□□ -1.28
MRD1	Q06106	GEF1	YJR040W	2340 nt		7.03	□□□□□ -1.28
MRD1	Q06106	YDL129W	YDL129W	876 nt		7.03	□□□□□ -1.28
MRD1	Q06106	RRS1	YOR294W	612 nt		7.03	□□□□□ -1.28
MRD1	Q06106	YCK1	YHR135C	1617 nt		7.02	□□□□□ -1.29
MRD1	Q06106	CDC34	YDR054C	888 nt		7.02	□□□□□ -1.29
MRD1	Q06106	TMT1	YER175C	900 nt		7.02	□□□□□ -1.29
MRD1	Q06106	DMA1	YHR115C	1251 nt		7.02	□□□□□ -1.29
MRD1	Q06106	YOR300W	YOR300W	309 nt		7.02	□□□□□ -1.29
MRD1	Q06106	MRPS16	YPL013C	366 nt		7.02	□□□□□ -1.29
MRD1	Q06106	NMT1	YLR195C	1368 nt		7.02	□□□□□ -1.29
MRD1	Q06106	YDR034W-B	YDR034W-B	156 nt		7.01	□□□□□ -1.29
MRD1	Q06106	HGH1	YGR187C	1185 nt		7.01	□□□□□ -1.29
MRD1	Q06106	SNN1	YNL086W	309 nt		7.01	□□□□□ -1.29
MRD1	Q06106	UTP4	YDR324C	2331 nt		7.01	□□□□□ -1.29
MRD1	Q06106	MDM31	YHR194W	1740 nt		7.01	□□□□□ -1.29

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 27.6 ms