Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DEUP1Q05D60 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DEUP1Q05D60 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DEUP1Q05D60 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DEUP1Q05D60 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DEUP1Q05D60 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DEUP1Q05D60 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DEUP1Q05D60 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DEUP1Q05D60 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DEUP1Q05D60 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DEUP1Q05D60 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DEUP1Q05D60 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DEUP1Q05D60 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DEUP1Q05D60 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
DEUP1Q05D60 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DEUP1Q05D60 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DEUP1Q05D60 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DEUP1Q05D60 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DEUP1Q05D60 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DEUP1Q05D60 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DEUP1Q05D60 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DEUP1Q05D60 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
DEUP1Q05D60 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DEUP1Q05D60 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DEUP1Q05D60 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DEUP1Q05D60 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DEUP1Q05D60 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DEUP1Q05D60 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DEUP1Q05D60 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DEUP1Q05D60 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
DEUP1Q05D60 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DEUP1Q05D60 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DEUP1Q05D60 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DEUP1Q05D60 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
DEUP1Q05D60 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DEUP1Q05D60 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DEUP1Q05D60 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DEUP1Q05D60 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DEUP1Q05D60 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
DEUP1Q05D60 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
DEUP1Q05D60 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DEUP1Q05D60 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DEUP1Q05D60 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DEUP1Q05D60 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DEUP1Q05D60 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DEUP1Q05D60 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DEUP1Q05D60 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
DEUP1Q05D60 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DEUP1Q05D60 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DEUP1Q05D60 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DEUP1Q05D60 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DEUP1Q05D60 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DEUP1Q05D60 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DEUP1Q05D60 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DEUP1Q05D60 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DEUP1Q05D60 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DEUP1Q05D60 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DEUP1Q05D60 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DEUP1Q05D60 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
DEUP1Q05D60 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DEUP1Q05D60 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DEUP1Q05D60 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DEUP1Q05D60 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DEUP1Q05D60 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DEUP1Q05D60 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DEUP1Q05D60 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DEUP1Q05D60 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DEUP1Q05D60 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DEUP1Q05D60 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
DEUP1Q05D60 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DEUP1Q05D60 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DEUP1Q05D60 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DEUP1Q05D60 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
DEUP1Q05D60 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DEUP1Q05D60 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DEUP1Q05D60 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DEUP1Q05D60 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DEUP1Q05D60 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DEUP1Q05D60 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DEUP1Q05D60 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DEUP1Q05D60 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DEUP1Q05D60 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DEUP1Q05D60 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DEUP1Q05D60 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DEUP1Q05D60 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DEUP1Q05D60 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DEUP1Q05D60 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DEUP1Q05D60 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DEUP1Q05D60 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DEUP1Q05D60 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
DEUP1Q05D60 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DEUP1Q05D60 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DEUP1Q05D60 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
DEUP1Q05D60 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
DEUP1Q05D60 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DEUP1Q05D60 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DEUP1Q05D60 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DEUP1Q05D60 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DEUP1Q05D60 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DEUP1Q05D60 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms