Protein–RNA interactions for Protein: Q05AH6

SPINDOC, SPIN1-docking protein, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINDOCQ05AH6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPINDOCQ05AH6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPINDOCQ05AH6 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPINDOCQ05AH6 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPINDOCQ05AH6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPINDOCQ05AH6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPINDOCQ05AH6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPINDOCQ05AH6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPINDOCQ05AH6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPINDOCQ05AH6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPINDOCQ05AH6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPINDOCQ05AH6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPINDOCQ05AH6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPINDOCQ05AH6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPINDOCQ05AH6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPINDOCQ05AH6 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPINDOCQ05AH6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPINDOCQ05AH6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPINDOCQ05AH6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPINDOCQ05AH6 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPINDOCQ05AH6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SPINDOCQ05AH6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPINDOCQ05AH6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPINDOCQ05AH6 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPINDOCQ05AH6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPINDOCQ05AH6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SPINDOCQ05AH6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPINDOCQ05AH6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPINDOCQ05AH6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPINDOCQ05AH6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPINDOCQ05AH6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPINDOCQ05AH6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPINDOCQ05AH6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPINDOCQ05AH6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPINDOCQ05AH6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPINDOCQ05AH6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPINDOCQ05AH6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPINDOCQ05AH6 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPINDOCQ05AH6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPINDOCQ05AH6 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPINDOCQ05AH6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPINDOCQ05AH6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPINDOCQ05AH6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPINDOCQ05AH6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPINDOCQ05AH6 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SPINDOCQ05AH6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SPINDOCQ05AH6 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPINDOCQ05AH6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPINDOCQ05AH6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPINDOCQ05AH6 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPINDOCQ05AH6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPINDOCQ05AH6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPINDOCQ05AH6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPINDOCQ05AH6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SPINDOCQ05AH6 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SPINDOCQ05AH6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPINDOCQ05AH6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPINDOCQ05AH6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPINDOCQ05AH6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPINDOCQ05AH6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPINDOCQ05AH6 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPINDOCQ05AH6 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPINDOCQ05AH6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPINDOCQ05AH6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPINDOCQ05AH6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPINDOCQ05AH6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPINDOCQ05AH6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPINDOCQ05AH6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPINDOCQ05AH6 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPINDOCQ05AH6 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPINDOCQ05AH6 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPINDOCQ05AH6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPINDOCQ05AH6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPINDOCQ05AH6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPINDOCQ05AH6 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPINDOCQ05AH6 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPINDOCQ05AH6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPINDOCQ05AH6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPINDOCQ05AH6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPINDOCQ05AH6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPINDOCQ05AH6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPINDOCQ05AH6 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPINDOCQ05AH6 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPINDOCQ05AH6 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPINDOCQ05AH6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPINDOCQ05AH6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPINDOCQ05AH6 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPINDOCQ05AH6 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPINDOCQ05AH6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SPINDOCQ05AH6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPINDOCQ05AH6 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPINDOCQ05AH6 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPINDOCQ05AH6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPINDOCQ05AH6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPINDOCQ05AH6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPINDOCQ05AH6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPINDOCQ05AH6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPINDOCQ05AH6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPINDOCQ05AH6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPINDOCQ05AH6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms