Protein–RNA interactions for Protein: Q05AH6

SPINDOC, SPIN1-docking protein, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINDOCQ05AH6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPINDOCQ05AH6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPINDOCQ05AH6 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPINDOCQ05AH6 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPINDOCQ05AH6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPINDOCQ05AH6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPINDOCQ05AH6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPINDOCQ05AH6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPINDOCQ05AH6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPINDOCQ05AH6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPINDOCQ05AH6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPINDOCQ05AH6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPINDOCQ05AH6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPINDOCQ05AH6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPINDOCQ05AH6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPINDOCQ05AH6 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPINDOCQ05AH6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPINDOCQ05AH6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPINDOCQ05AH6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPINDOCQ05AH6 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPINDOCQ05AH6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SPINDOCQ05AH6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPINDOCQ05AH6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPINDOCQ05AH6 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPINDOCQ05AH6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPINDOCQ05AH6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SPINDOCQ05AH6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPINDOCQ05AH6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPINDOCQ05AH6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPINDOCQ05AH6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPINDOCQ05AH6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPINDOCQ05AH6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPINDOCQ05AH6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPINDOCQ05AH6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPINDOCQ05AH6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPINDOCQ05AH6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPINDOCQ05AH6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPINDOCQ05AH6 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPINDOCQ05AH6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPINDOCQ05AH6 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPINDOCQ05AH6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPINDOCQ05AH6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPINDOCQ05AH6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPINDOCQ05AH6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPINDOCQ05AH6 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SPINDOCQ05AH6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SPINDOCQ05AH6 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPINDOCQ05AH6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPINDOCQ05AH6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPINDOCQ05AH6 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPINDOCQ05AH6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPINDOCQ05AH6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPINDOCQ05AH6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPINDOCQ05AH6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SPINDOCQ05AH6 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SPINDOCQ05AH6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPINDOCQ05AH6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPINDOCQ05AH6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPINDOCQ05AH6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPINDOCQ05AH6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPINDOCQ05AH6 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPINDOCQ05AH6 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPINDOCQ05AH6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPINDOCQ05AH6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPINDOCQ05AH6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPINDOCQ05AH6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPINDOCQ05AH6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPINDOCQ05AH6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPINDOCQ05AH6 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPINDOCQ05AH6 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPINDOCQ05AH6 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPINDOCQ05AH6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPINDOCQ05AH6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPINDOCQ05AH6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPINDOCQ05AH6 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPINDOCQ05AH6 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPINDOCQ05AH6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPINDOCQ05AH6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPINDOCQ05AH6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPINDOCQ05AH6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPINDOCQ05AH6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPINDOCQ05AH6 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPINDOCQ05AH6 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPINDOCQ05AH6 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPINDOCQ05AH6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPINDOCQ05AH6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPINDOCQ05AH6 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPINDOCQ05AH6 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPINDOCQ05AH6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SPINDOCQ05AH6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPINDOCQ05AH6 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPINDOCQ05AH6 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPINDOCQ05AH6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPINDOCQ05AH6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPINDOCQ05AH6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPINDOCQ05AH6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPINDOCQ05AH6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPINDOCQ05AH6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPINDOCQ05AH6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPINDOCQ05AH6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms