Protein–RNA interactions for Protein: Q05940

SLC18A2, Synaptic vesicular amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A2Q05940 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC18A2Q05940 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC18A2Q05940 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC18A2Q05940 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC18A2Q05940 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC18A2Q05940 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC18A2Q05940 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC18A2Q05940 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC18A2Q05940 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC18A2Q05940 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC18A2Q05940 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC18A2Q05940 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC18A2Q05940 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC18A2Q05940 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC18A2Q05940 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC18A2Q05940 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC18A2Q05940 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC18A2Q05940 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC18A2Q05940 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC18A2Q05940 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC18A2Q05940 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC18A2Q05940 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC18A2Q05940 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC18A2Q05940 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC18A2Q05940 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC18A2Q05940 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC18A2Q05940 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC18A2Q05940 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC18A2Q05940 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC18A2Q05940 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC18A2Q05940 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC18A2Q05940 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC18A2Q05940 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC18A2Q05940 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC18A2Q05940 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC18A2Q05940 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC18A2Q05940 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC18A2Q05940 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC18A2Q05940 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC18A2Q05940 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC18A2Q05940 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC18A2Q05940 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC18A2Q05940 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC18A2Q05940 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC18A2Q05940 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC18A2Q05940 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC18A2Q05940 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC18A2Q05940 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC18A2Q05940 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC18A2Q05940 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC18A2Q05940 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SLC18A2Q05940 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC18A2Q05940 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC18A2Q05940 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC18A2Q05940 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC18A2Q05940 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC18A2Q05940 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC18A2Q05940 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC18A2Q05940 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC18A2Q05940 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC18A2Q05940 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC18A2Q05940 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC18A2Q05940 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC18A2Q05940 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC18A2Q05940 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC18A2Q05940 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC18A2Q05940 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC18A2Q05940 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC18A2Q05940 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC18A2Q05940 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC18A2Q05940 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC18A2Q05940 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC18A2Q05940 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC18A2Q05940 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC18A2Q05940 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC18A2Q05940 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC18A2Q05940 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC18A2Q05940 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC18A2Q05940 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC18A2Q05940 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC18A2Q05940 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC18A2Q05940 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC18A2Q05940 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC18A2Q05940 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC18A2Q05940 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC18A2Q05940 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC18A2Q05940 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC18A2Q05940 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC18A2Q05940 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC18A2Q05940 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC18A2Q05940 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC18A2Q05940 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC18A2Q05940 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC18A2Q05940 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC18A2Q05940 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC18A2Q05940 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC18A2Q05940 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC18A2Q05940 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC18A2Q05940 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC18A2Q05940 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms