Protein–RNA interactions for Protein: Q05793

Hspg2, Basement membrane-specific heparan sulfate proteoglycan core protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 3,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hspg2Q05793 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hspg2Q05793 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hspg2Q05793 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hspg2Q05793 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hspg2Q05793 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hspg2Q05793 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hspg2Q05793 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hspg2Q05793 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hspg2Q05793 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hspg2Q05793 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hspg2Q05793 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hspg2Q05793 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hspg2Q05793 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hspg2Q05793 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hspg2Q05793 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hspg2Q05793 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hspg2Q05793 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hspg2Q05793 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Hspg2Q05793 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hspg2Q05793 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hspg2Q05793 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hspg2Q05793 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hspg2Q05793 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hspg2Q05793 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Hspg2Q05793 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hspg2Q05793 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hspg2Q05793 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Hspg2Q05793 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hspg2Q05793 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hspg2Q05793 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hspg2Q05793 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hspg2Q05793 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hspg2Q05793 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hspg2Q05793 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hspg2Q05793 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hspg2Q05793 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hspg2Q05793 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hspg2Q05793 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hspg2Q05793 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hspg2Q05793 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hspg2Q05793 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hspg2Q05793 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hspg2Q05793 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hspg2Q05793 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hspg2Q05793 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hspg2Q05793 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hspg2Q05793 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hspg2Q05793 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hspg2Q05793 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hspg2Q05793 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hspg2Q05793 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hspg2Q05793 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hspg2Q05793 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hspg2Q05793 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Hspg2Q05793 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Hspg2Q05793 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hspg2Q05793 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hspg2Q05793 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hspg2Q05793 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hspg2Q05793 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hspg2Q05793 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hspg2Q05793 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hspg2Q05793 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hspg2Q05793 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hspg2Q05793 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hspg2Q05793 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Hspg2Q05793 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hspg2Q05793 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hspg2Q05793 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hspg2Q05793 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hspg2Q05793 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hspg2Q05793 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hspg2Q05793 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hspg2Q05793 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Hspg2Q05793 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hspg2Q05793 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hspg2Q05793 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hspg2Q05793 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hspg2Q05793 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hspg2Q05793 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hspg2Q05793 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hspg2Q05793 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hspg2Q05793 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hspg2Q05793 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hspg2Q05793 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hspg2Q05793 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hspg2Q05793 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hspg2Q05793 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hspg2Q05793 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Hspg2Q05793 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hspg2Q05793 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hspg2Q05793 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hspg2Q05793 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Hspg2Q05793 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hspg2Q05793 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hspg2Q05793 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hspg2Q05793 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Hspg2Q05793 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hspg2Q05793 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hspg2Q05793 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms