Protein–RNA interactions for Protein: Q05066

SRY, Sex-determining region Y protein, humanhuman

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRYQ05066 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SRYQ05066 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SRYQ05066 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SRYQ05066 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SRYQ05066 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SRYQ05066 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SRYQ05066 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SRYQ05066 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SRYQ05066 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SRYQ05066 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SRYQ05066 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SRYQ05066 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SRYQ05066 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SRYQ05066 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SRYQ05066 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SRYQ05066 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SRYQ05066 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SRYQ05066 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SRYQ05066 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SRYQ05066 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SRYQ05066 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SRYQ05066 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SRYQ05066 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SRYQ05066 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SRYQ05066 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SRYQ05066 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SRYQ05066 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SRYQ05066 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SRYQ05066 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SRYQ05066 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SRYQ05066 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SRYQ05066 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SRYQ05066 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SRYQ05066 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SRYQ05066 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SRYQ05066 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SRYQ05066 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SRYQ05066 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SRYQ05066 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SRYQ05066 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SRYQ05066 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SRYQ05066 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SRYQ05066 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SRYQ05066 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SRYQ05066 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SRYQ05066 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SRYQ05066 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SRYQ05066 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SRYQ05066 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SRYQ05066 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SRYQ05066 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SRYQ05066 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SRYQ05066 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SRYQ05066 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SRYQ05066 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SRYQ05066 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SRYQ05066 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SRYQ05066 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SRYQ05066 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SRYQ05066 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SRYQ05066 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SRYQ05066 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SRYQ05066 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SRYQ05066 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SRYQ05066 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SRYQ05066 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SRYQ05066 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SRYQ05066 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SRYQ05066 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SRYQ05066 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SRYQ05066 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SRYQ05066 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
SRYQ05066 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SRYQ05066 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SRYQ05066 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SRYQ05066 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SRYQ05066 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SRYQ05066 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SRYQ05066 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SRYQ05066 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SRYQ05066 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SRYQ05066 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SRYQ05066 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SRYQ05066 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SRYQ05066 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SRYQ05066 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SRYQ05066 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SRYQ05066 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SRYQ05066 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SRYQ05066 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SRYQ05066 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SRYQ05066 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SRYQ05066 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SRYQ05066 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SRYQ05066 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SRYQ05066 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SRYQ05066 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SRYQ05066 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SRYQ05066 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SRYQ05066 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.7 ms