Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Sox12Q04890 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Sox12Q04890 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Sox12Q04890 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Sox12Q04890 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Sox12Q04890 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Sox12Q04890 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Sox12Q04890 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Sox12Q04890 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Sox12Q04890 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Sox12Q04890 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Sox12Q04890 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Sox12Q04890 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Sox12Q04890 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Sox12Q04890 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Sox12Q04890 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Sox12Q04890 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Sox12Q04890 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Sox12Q04890 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Sox12Q04890 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Sox12Q04890 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
Sox12Q04890 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.4
Sox12Q04890 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Sox12Q04890 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
Sox12Q04890 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Sox12Q04890 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
Sox12Q04890 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
Sox12Q04890 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Sox12Q04890 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC30■■■□□ 2.39
Sox12Q04890 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Sox12Q04890 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Sox12Q04890 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Sox12Q04890 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Sox12Q04890 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Sox12Q04890 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Sox12Q04890 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Sox12Q04890 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Sox12Q04890 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Sox12Q04890 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Sox12Q04890 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Sox12Q04890 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
Sox12Q04890 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
Sox12Q04890 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Sox12Q04890 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
Sox12Q04890 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Sox12Q04890 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Sox12Q04890 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Sox12Q04890 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Sox12Q04890 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Sox12Q04890 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Sox12Q04890 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Sox12Q04890 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
Sox12Q04890 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Sox12Q04890 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Sox12Q04890 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Sox12Q04890 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Sox12Q04890 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
Sox12Q04890 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Sox12Q04890 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Sox12Q04890 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Sox12Q04890 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
Sox12Q04890 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Sox12Q04890 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Sox12Q04890 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Sox12Q04890 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Sox12Q04890 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Sox12Q04890 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Sox12Q04890 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
Sox12Q04890 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Sox12Q04890 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
Sox12Q04890 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Sox12Q04890 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Sox12Q04890 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Sox12Q04890 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Sox12Q04890 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Sox12Q04890 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Sox12Q04890 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Sox12Q04890 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Sox12Q04890 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Sox12Q04890 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
Sox12Q04890 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Sox12Q04890 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Sox12Q04890 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Sox12Q04890 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Sox12Q04890 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Sox12Q04890 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Sox12Q04890 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Sox12Q04890 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Sox12Q04890 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Sox12Q04890 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Sox12Q04890 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Sox12Q04890 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Sox12Q04890 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Sox12Q04890 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Sox12Q04890 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Sox12Q04890 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Sox12Q04890 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Sox12Q04890 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Sox12Q04890 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Sox12Q04890 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms