Protein–RNA interactions for Protein: Q04771

ACVR1, Activin receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1Q04771 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACVR1Q04771 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACVR1Q04771 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACVR1Q04771 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACVR1Q04771 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACVR1Q04771 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ACVR1Q04771 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACVR1Q04771 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACVR1Q04771 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACVR1Q04771 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ACVR1Q04771 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACVR1Q04771 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACVR1Q04771 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACVR1Q04771 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACVR1Q04771 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACVR1Q04771 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACVR1Q04771 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACVR1Q04771 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACVR1Q04771 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACVR1Q04771 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACVR1Q04771 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACVR1Q04771 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACVR1Q04771 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACVR1Q04771 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACVR1Q04771 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACVR1Q04771 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACVR1Q04771 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACVR1Q04771 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ACVR1Q04771 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ACVR1Q04771 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ACVR1Q04771 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACVR1Q04771 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACVR1Q04771 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACVR1Q04771 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACVR1Q04771 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACVR1Q04771 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACVR1Q04771 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACVR1Q04771 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ACVR1Q04771 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACVR1Q04771 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACVR1Q04771 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACVR1Q04771 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACVR1Q04771 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ACVR1Q04771 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACVR1Q04771 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACVR1Q04771 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACVR1Q04771 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACVR1Q04771 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACVR1Q04771 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACVR1Q04771 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACVR1Q04771 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ACVR1Q04771 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACVR1Q04771 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACVR1Q04771 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACVR1Q04771 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ACVR1Q04771 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ACVR1Q04771 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ACVR1Q04771 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACVR1Q04771 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ACVR1Q04771 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACVR1Q04771 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ACVR1Q04771 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ACVR1Q04771 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ACVR1Q04771 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ACVR1Q04771 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACVR1Q04771 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACVR1Q04771 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACVR1Q04771 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACVR1Q04771 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACVR1Q04771 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACVR1Q04771 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACVR1Q04771 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACVR1Q04771 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACVR1Q04771 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACVR1Q04771 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACVR1Q04771 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ACVR1Q04771 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACVR1Q04771 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACVR1Q04771 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACVR1Q04771 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACVR1Q04771 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACVR1Q04771 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACVR1Q04771 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACVR1Q04771 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACVR1Q04771 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACVR1Q04771 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACVR1Q04771 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACVR1Q04771 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACVR1Q04771 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACVR1Q04771 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACVR1Q04771 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ACVR1Q04771 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACVR1Q04771 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACVR1Q04771 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACVR1Q04771 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACVR1Q04771 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ACVR1Q04771 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACVR1Q04771 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACVR1Q04771 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACVR1Q04771 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms