Protein–RNA interactions for Protein: Q04519

Smpd1, Sphingomyelin phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd1Q04519 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smpd1Q04519 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smpd1Q04519 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smpd1Q04519 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smpd1Q04519 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smpd1Q04519 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smpd1Q04519 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smpd1Q04519 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smpd1Q04519 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smpd1Q04519 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smpd1Q04519 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Smpd1Q04519 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smpd1Q04519 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smpd1Q04519 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smpd1Q04519 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smpd1Q04519 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smpd1Q04519 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smpd1Q04519 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smpd1Q04519 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smpd1Q04519 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smpd1Q04519 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smpd1Q04519 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smpd1Q04519 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smpd1Q04519 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smpd1Q04519 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smpd1Q04519 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smpd1Q04519 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smpd1Q04519 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smpd1Q04519 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smpd1Q04519 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smpd1Q04519 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smpd1Q04519 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smpd1Q04519 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smpd1Q04519 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Smpd1Q04519 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smpd1Q04519 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smpd1Q04519 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smpd1Q04519 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smpd1Q04519 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smpd1Q04519 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smpd1Q04519 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smpd1Q04519 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smpd1Q04519 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smpd1Q04519 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Smpd1Q04519 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smpd1Q04519 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smpd1Q04519 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Smpd1Q04519 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smpd1Q04519 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smpd1Q04519 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smpd1Q04519 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smpd1Q04519 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smpd1Q04519 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smpd1Q04519 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smpd1Q04519 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smpd1Q04519 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smpd1Q04519 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smpd1Q04519 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smpd1Q04519 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smpd1Q04519 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smpd1Q04519 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smpd1Q04519 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smpd1Q04519 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smpd1Q04519 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smpd1Q04519 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smpd1Q04519 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smpd1Q04519 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smpd1Q04519 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smpd1Q04519 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smpd1Q04519 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smpd1Q04519 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smpd1Q04519 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smpd1Q04519 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smpd1Q04519 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smpd1Q04519 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Smpd1Q04519 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Smpd1Q04519 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Smpd1Q04519 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Smpd1Q04519 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Smpd1Q04519 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smpd1Q04519 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smpd1Q04519 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smpd1Q04519 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smpd1Q04519 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smpd1Q04519 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smpd1Q04519 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smpd1Q04519 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smpd1Q04519 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smpd1Q04519 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smpd1Q04519 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smpd1Q04519 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smpd1Q04519 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smpd1Q04519 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smpd1Q04519 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smpd1Q04519 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smpd1Q04519 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smpd1Q04519 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Smpd1Q04519 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smpd1Q04519 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smpd1Q04519 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.5 ms