Protein–RNA interactions for Protein: Q02956

Prkcz, Protein kinase C zeta type, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkczQ02956 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PrkczQ02956 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PrkczQ02956 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PrkczQ02956 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PrkczQ02956 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PrkczQ02956 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PrkczQ02956 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PrkczQ02956 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PrkczQ02956 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PrkczQ02956 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PrkczQ02956 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PrkczQ02956 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PrkczQ02956 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PrkczQ02956 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PrkczQ02956 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PrkczQ02956 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PrkczQ02956 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PrkczQ02956 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PrkczQ02956 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PrkczQ02956 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PrkczQ02956 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PrkczQ02956 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PrkczQ02956 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PrkczQ02956 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PrkczQ02956 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PrkczQ02956 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PrkczQ02956 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PrkczQ02956 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PrkczQ02956 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PrkczQ02956 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PrkczQ02956 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PrkczQ02956 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PrkczQ02956 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PrkczQ02956 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PrkczQ02956 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PrkczQ02956 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PrkczQ02956 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PrkczQ02956 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PrkczQ02956 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PrkczQ02956 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PrkczQ02956 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PrkczQ02956 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PrkczQ02956 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PrkczQ02956 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PrkczQ02956 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PrkczQ02956 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PrkczQ02956 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PrkczQ02956 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PrkczQ02956 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PrkczQ02956 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PrkczQ02956 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PrkczQ02956 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PrkczQ02956 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PrkczQ02956 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PrkczQ02956 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PrkczQ02956 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PrkczQ02956 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PrkczQ02956 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PrkczQ02956 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PrkczQ02956 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PrkczQ02956 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PrkczQ02956 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PrkczQ02956 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PrkczQ02956 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PrkczQ02956 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PrkczQ02956 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PrkczQ02956 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PrkczQ02956 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PrkczQ02956 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PrkczQ02956 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PrkczQ02956 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PrkczQ02956 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PrkczQ02956 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PrkczQ02956 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PrkczQ02956 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PrkczQ02956 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PrkczQ02956 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PrkczQ02956 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PrkczQ02956 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PrkczQ02956 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PrkczQ02956 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PrkczQ02956 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PrkczQ02956 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PrkczQ02956 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PrkczQ02956 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PrkczQ02956 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PrkczQ02956 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PrkczQ02956 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PrkczQ02956 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PrkczQ02956 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PrkczQ02956 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PrkczQ02956 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PrkczQ02956 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PrkczQ02956 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PrkczQ02956 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PrkczQ02956 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PrkczQ02956 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PrkczQ02956 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PrkczQ02956 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PrkczQ02956 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms