Protein–RNA interactions for Protein: Q02338

BDH1, D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BDH1Q02338 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BDH1Q02338 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BDH1Q02338 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BDH1Q02338 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BDH1Q02338 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BDH1Q02338 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BDH1Q02338 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BDH1Q02338 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BDH1Q02338 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BDH1Q02338 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BDH1Q02338 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BDH1Q02338 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BDH1Q02338 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BDH1Q02338 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BDH1Q02338 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BDH1Q02338 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BDH1Q02338 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BDH1Q02338 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
BDH1Q02338 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BDH1Q02338 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BDH1Q02338 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BDH1Q02338 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BDH1Q02338 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BDH1Q02338 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BDH1Q02338 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
BDH1Q02338 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BDH1Q02338 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BDH1Q02338 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BDH1Q02338 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BDH1Q02338 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BDH1Q02338 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BDH1Q02338 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BDH1Q02338 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BDH1Q02338 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BDH1Q02338 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BDH1Q02338 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BDH1Q02338 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
BDH1Q02338 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.33■■□□□ 1
BDH1Q02338 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
BDH1Q02338 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
BDH1Q02338 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
BDH1Q02338 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
BDH1Q02338 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
BDH1Q02338 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
BDH1Q02338 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
BDH1Q02338 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BDH1Q02338 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BDH1Q02338 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BDH1Q02338 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BDH1Q02338 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BDH1Q02338 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
BDH1Q02338 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BDH1Q02338 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
BDH1Q02338 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BDH1Q02338 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BDH1Q02338 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
BDH1Q02338 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BDH1Q02338 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BDH1Q02338 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BDH1Q02338 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BDH1Q02338 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BDH1Q02338 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BDH1Q02338 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BDH1Q02338 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BDH1Q02338 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BDH1Q02338 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BDH1Q02338 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BDH1Q02338 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BDH1Q02338 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BDH1Q02338 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.28■■□□□ 1
BDH1Q02338 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
BDH1Q02338 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BDH1Q02338 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BDH1Q02338 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
BDH1Q02338 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
BDH1Q02338 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
BDH1Q02338 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
BDH1Q02338 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BDH1Q02338 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BDH1Q02338 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BDH1Q02338 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BDH1Q02338 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BDH1Q02338 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BDH1Q02338 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BDH1Q02338 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BDH1Q02338 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BDH1Q02338 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BDH1Q02338 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BDH1Q02338 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BDH1Q02338 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
BDH1Q02338 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BDH1Q02338 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BDH1Q02338 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BDH1Q02338 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BDH1Q02338 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BDH1Q02338 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BDH1Q02338 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BDH1Q02338 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BDH1Q02338 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BDH1Q02338 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.2 ms