Protein–RNA interactions for Protein: Q02246

CNTN2, Contactin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN2Q02246 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CNTN2Q02246 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CNTN2Q02246 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CNTN2Q02246 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CNTN2Q02246 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CNTN2Q02246 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CNTN2Q02246 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CNTN2Q02246 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CNTN2Q02246 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CNTN2Q02246 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CNTN2Q02246 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CNTN2Q02246 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CNTN2Q02246 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CNTN2Q02246 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CNTN2Q02246 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CNTN2Q02246 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CNTN2Q02246 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CNTN2Q02246 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CNTN2Q02246 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CNTN2Q02246 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CNTN2Q02246 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CNTN2Q02246 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CNTN2Q02246 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CNTN2Q02246 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CNTN2Q02246 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CNTN2Q02246 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CNTN2Q02246 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CNTN2Q02246 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CNTN2Q02246 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CNTN2Q02246 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CNTN2Q02246 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CNTN2Q02246 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CNTN2Q02246 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CNTN2Q02246 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CNTN2Q02246 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CNTN2Q02246 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CNTN2Q02246 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CNTN2Q02246 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CNTN2Q02246 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CNTN2Q02246 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CNTN2Q02246 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CNTN2Q02246 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CNTN2Q02246 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CNTN2Q02246 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CNTN2Q02246 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CNTN2Q02246 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CNTN2Q02246 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CNTN2Q02246 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CNTN2Q02246 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CNTN2Q02246 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CNTN2Q02246 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CNTN2Q02246 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CNTN2Q02246 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CNTN2Q02246 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CNTN2Q02246 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CNTN2Q02246 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CNTN2Q02246 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CNTN2Q02246 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CNTN2Q02246 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CNTN2Q02246 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CNTN2Q02246 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CNTN2Q02246 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CNTN2Q02246 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CNTN2Q02246 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CNTN2Q02246 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CNTN2Q02246 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CNTN2Q02246 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CNTN2Q02246 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CNTN2Q02246 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CNTN2Q02246 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CNTN2Q02246 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CNTN2Q02246 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CNTN2Q02246 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CNTN2Q02246 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CNTN2Q02246 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CNTN2Q02246 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CNTN2Q02246 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CNTN2Q02246 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CNTN2Q02246 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CNTN2Q02246 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CNTN2Q02246 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CNTN2Q02246 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CNTN2Q02246 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CNTN2Q02246 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CNTN2Q02246 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CNTN2Q02246 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CNTN2Q02246 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CNTN2Q02246 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CNTN2Q02246 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CNTN2Q02246 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CNTN2Q02246 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CNTN2Q02246 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CNTN2Q02246 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CNTN2Q02246 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CNTN2Q02246 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CNTN2Q02246 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CNTN2Q02246 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CNTN2Q02246 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CNTN2Q02246 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CNTN2Q02246 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.6 ms