Protein–RNA interactions for Protein: Q02242

Pdcd1, Programmed cell death protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd1Q02242 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pdcd1Q02242 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pdcd1Q02242 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pdcd1Q02242 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pdcd1Q02242 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pdcd1Q02242 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pdcd1Q02242 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pdcd1Q02242 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pdcd1Q02242 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pdcd1Q02242 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Pdcd1Q02242 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pdcd1Q02242 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pdcd1Q02242 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pdcd1Q02242 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pdcd1Q02242 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pdcd1Q02242 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pdcd1Q02242 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pdcd1Q02242 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pdcd1Q02242 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pdcd1Q02242 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pdcd1Q02242 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Pdcd1Q02242 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pdcd1Q02242 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pdcd1Q02242 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pdcd1Q02242 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pdcd1Q02242 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pdcd1Q02242 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pdcd1Q02242 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pdcd1Q02242 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Pdcd1Q02242 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pdcd1Q02242 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Pdcd1Q02242 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pdcd1Q02242 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pdcd1Q02242 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pdcd1Q02242 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pdcd1Q02242 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pdcd1Q02242 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pdcd1Q02242 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pdcd1Q02242 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pdcd1Q02242 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pdcd1Q02242 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pdcd1Q02242 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pdcd1Q02242 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pdcd1Q02242 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pdcd1Q02242 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pdcd1Q02242 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pdcd1Q02242 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pdcd1Q02242 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdcd1Q02242 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdcd1Q02242 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdcd1Q02242 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdcd1Q02242 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdcd1Q02242 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdcd1Q02242 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdcd1Q02242 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdcd1Q02242 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdcd1Q02242 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdcd1Q02242 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdcd1Q02242 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdcd1Q02242 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdcd1Q02242 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdcd1Q02242 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdcd1Q02242 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdcd1Q02242 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdcd1Q02242 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdcd1Q02242 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pdcd1Q02242 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pdcd1Q02242 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pdcd1Q02242 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pdcd1Q02242 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pdcd1Q02242 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pdcd1Q02242 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pdcd1Q02242 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pdcd1Q02242 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pdcd1Q02242 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pdcd1Q02242 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pdcd1Q02242 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Pdcd1Q02242 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pdcd1Q02242 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pdcd1Q02242 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pdcd1Q02242 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pdcd1Q02242 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pdcd1Q02242 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pdcd1Q02242 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pdcd1Q02242 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pdcd1Q02242 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pdcd1Q02242 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pdcd1Q02242 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pdcd1Q02242 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pdcd1Q02242 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pdcd1Q02242 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pdcd1Q02242 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pdcd1Q02242 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pdcd1Q02242 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pdcd1Q02242 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pdcd1Q02242 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pdcd1Q02242 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pdcd1Q02242 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pdcd1Q02242 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pdcd1Q02242 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.2 ms