Protein–RNA interactions for Protein: Q02156

PRKCE, Protein kinase C epsilon type, humanhuman

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCEQ02156 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRKCEQ02156 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRKCEQ02156 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRKCEQ02156 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRKCEQ02156 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRKCEQ02156 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRKCEQ02156 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRKCEQ02156 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRKCEQ02156 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRKCEQ02156 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRKCEQ02156 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRKCEQ02156 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRKCEQ02156 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRKCEQ02156 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRKCEQ02156 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRKCEQ02156 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRKCEQ02156 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRKCEQ02156 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRKCEQ02156 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRKCEQ02156 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRKCEQ02156 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
PRKCEQ02156 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRKCEQ02156 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRKCEQ02156 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRKCEQ02156 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PRKCEQ02156 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PRKCEQ02156 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PRKCEQ02156 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PRKCEQ02156 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRKCEQ02156 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRKCEQ02156 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
PRKCEQ02156 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRKCEQ02156 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRKCEQ02156 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRKCEQ02156 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRKCEQ02156 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
PRKCEQ02156 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRKCEQ02156 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRKCEQ02156 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRKCEQ02156 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRKCEQ02156 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRKCEQ02156 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRKCEQ02156 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRKCEQ02156 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRKCEQ02156 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRKCEQ02156 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRKCEQ02156 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
PRKCEQ02156 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRKCEQ02156 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PRKCEQ02156 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PRKCEQ02156 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PRKCEQ02156 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PRKCEQ02156 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRKCEQ02156 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRKCEQ02156 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRKCEQ02156 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRKCEQ02156 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRKCEQ02156 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRKCEQ02156 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRKCEQ02156 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRKCEQ02156 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRKCEQ02156 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRKCEQ02156 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
PRKCEQ02156 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRKCEQ02156 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRKCEQ02156 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRKCEQ02156 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRKCEQ02156 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRKCEQ02156 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRKCEQ02156 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
PRKCEQ02156 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRKCEQ02156 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRKCEQ02156 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRKCEQ02156 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRKCEQ02156 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
PRKCEQ02156 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRKCEQ02156 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRKCEQ02156 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRKCEQ02156 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRKCEQ02156 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRKCEQ02156 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRKCEQ02156 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRKCEQ02156 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRKCEQ02156 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRKCEQ02156 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRKCEQ02156 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
PRKCEQ02156 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRKCEQ02156 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
PRKCEQ02156 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
PRKCEQ02156 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRKCEQ02156 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRKCEQ02156 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRKCEQ02156 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRKCEQ02156 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRKCEQ02156 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRKCEQ02156 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRKCEQ02156 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRKCEQ02156 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRKCEQ02156 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRKCEQ02156 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms