Protein–RNA interactions for Protein: Q01768

Nme2, Nucleoside diphosphate kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme2Q01768 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nme2Q01768 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nme2Q01768 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Nme2Q01768 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nme2Q01768 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Nme2Q01768 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nme2Q01768 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nme2Q01768 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Nme2Q01768 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Nme2Q01768 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Nme2Q01768 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Nme2Q01768 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nme2Q01768 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Nme2Q01768 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nme2Q01768 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nme2Q01768 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nme2Q01768 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nme2Q01768 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nme2Q01768 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nme2Q01768 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nme2Q01768 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nme2Q01768 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nme2Q01768 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nme2Q01768 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nme2Q01768 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nme2Q01768 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nme2Q01768 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nme2Q01768 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nme2Q01768 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Nme2Q01768 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nme2Q01768 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nme2Q01768 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nme2Q01768 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nme2Q01768 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nme2Q01768 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nme2Q01768 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nme2Q01768 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nme2Q01768 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nme2Q01768 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nme2Q01768 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nme2Q01768 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nme2Q01768 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nme2Q01768 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nme2Q01768 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nme2Q01768 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nme2Q01768 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nme2Q01768 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Nme2Q01768 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nme2Q01768 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Nme2Q01768 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nme2Q01768 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nme2Q01768 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nme2Q01768 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nme2Q01768 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nme2Q01768 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nme2Q01768 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nme2Q01768 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nme2Q01768 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nme2Q01768 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nme2Q01768 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nme2Q01768 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nme2Q01768 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nme2Q01768 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nme2Q01768 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nme2Q01768 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nme2Q01768 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nme2Q01768 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nme2Q01768 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nme2Q01768 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nme2Q01768 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nme2Q01768 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nme2Q01768 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nme2Q01768 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nme2Q01768 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nme2Q01768 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nme2Q01768 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nme2Q01768 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nme2Q01768 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nme2Q01768 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nme2Q01768 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Nme2Q01768 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nme2Q01768 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nme2Q01768 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nme2Q01768 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nme2Q01768 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nme2Q01768 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nme2Q01768 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nme2Q01768 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nme2Q01768 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Nme2Q01768 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nme2Q01768 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nme2Q01768 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nme2Q01768 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nme2Q01768 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nme2Q01768 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nme2Q01768 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nme2Q01768 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nme2Q01768 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nme2Q01768 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nme2Q01768 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms