Protein–RNA interactions for Protein: Q01523

DEFA5, Defensin-5, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA5Q01523 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DEFA5Q01523 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DEFA5Q01523 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DEFA5Q01523 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DEFA5Q01523 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DEFA5Q01523 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DEFA5Q01523 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DEFA5Q01523 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DEFA5Q01523 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DEFA5Q01523 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DEFA5Q01523 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DEFA5Q01523 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DEFA5Q01523 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
DEFA5Q01523 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DEFA5Q01523 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DEFA5Q01523 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DEFA5Q01523 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DEFA5Q01523 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
DEFA5Q01523 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DEFA5Q01523 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DEFA5Q01523 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
DEFA5Q01523 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DEFA5Q01523 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DEFA5Q01523 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DEFA5Q01523 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DEFA5Q01523 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DEFA5Q01523 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DEFA5Q01523 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
DEFA5Q01523 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DEFA5Q01523 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DEFA5Q01523 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DEFA5Q01523 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DEFA5Q01523 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DEFA5Q01523 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DEFA5Q01523 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DEFA5Q01523 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DEFA5Q01523 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DEFA5Q01523 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DEFA5Q01523 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DEFA5Q01523 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DEFA5Q01523 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DEFA5Q01523 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DEFA5Q01523 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DEFA5Q01523 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DEFA5Q01523 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DEFA5Q01523 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DEFA5Q01523 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DEFA5Q01523 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DEFA5Q01523 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DEFA5Q01523 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DEFA5Q01523 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DEFA5Q01523 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DEFA5Q01523 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DEFA5Q01523 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DEFA5Q01523 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DEFA5Q01523 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DEFA5Q01523 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
DEFA5Q01523 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DEFA5Q01523 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DEFA5Q01523 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DEFA5Q01523 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
DEFA5Q01523 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DEFA5Q01523 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DEFA5Q01523 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
DEFA5Q01523 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DEFA5Q01523 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DEFA5Q01523 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DEFA5Q01523 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DEFA5Q01523 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DEFA5Q01523 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DEFA5Q01523 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DEFA5Q01523 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DEFA5Q01523 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DEFA5Q01523 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DEFA5Q01523 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20■□□□□ 0.79
DEFA5Q01523 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DEFA5Q01523 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DEFA5Q01523 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DEFA5Q01523 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC20■□□□□ 0.79
DEFA5Q01523 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
DEFA5Q01523 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
DEFA5Q01523 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DEFA5Q01523 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DEFA5Q01523 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DEFA5Q01523 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DEFA5Q01523 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DEFA5Q01523 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DEFA5Q01523 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DEFA5Q01523 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DEFA5Q01523 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DEFA5Q01523 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DEFA5Q01523 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DEFA5Q01523 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DEFA5Q01523 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DEFA5Q01523 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DEFA5Q01523 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DEFA5Q01523 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
DEFA5Q01523 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DEFA5Q01523 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DEFA5Q01523 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.8 ms