Protein–RNA interactions for Protein: Q00994

BEX3, Protein BEX3, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEX3Q00994 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
BEX3Q00994 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
BEX3Q00994 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
BEX3Q00994 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
BEX3Q00994 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
BEX3Q00994 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
BEX3Q00994 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
BEX3Q00994 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
BEX3Q00994 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
BEX3Q00994 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
BEX3Q00994 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
BEX3Q00994 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
BEX3Q00994 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
BEX3Q00994 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
BEX3Q00994 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
BEX3Q00994 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
BEX3Q00994 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
BEX3Q00994 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
BEX3Q00994 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
BEX3Q00994 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
BEX3Q00994 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BEX3Q00994 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BEX3Q00994 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BEX3Q00994 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BEX3Q00994 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BEX3Q00994 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
BEX3Q00994 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
BEX3Q00994 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
BEX3Q00994 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BEX3Q00994 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
BEX3Q00994 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BEX3Q00994 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BEX3Q00994 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
BEX3Q00994 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BEX3Q00994 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
BEX3Q00994 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BEX3Q00994 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
BEX3Q00994 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
BEX3Q00994 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
BEX3Q00994 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
BEX3Q00994 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BEX3Q00994 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
BEX3Q00994 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BEX3Q00994 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BEX3Q00994 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
BEX3Q00994 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
BEX3Q00994 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
BEX3Q00994 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
BEX3Q00994 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BEX3Q00994 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
BEX3Q00994 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
BEX3Q00994 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
BEX3Q00994 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
BEX3Q00994 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
BEX3Q00994 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
BEX3Q00994 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
BEX3Q00994 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
BEX3Q00994 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
BEX3Q00994 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
BEX3Q00994 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BEX3Q00994 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BEX3Q00994 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
BEX3Q00994 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
BEX3Q00994 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
BEX3Q00994 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
BEX3Q00994 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
BEX3Q00994 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
BEX3Q00994 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
BEX3Q00994 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
BEX3Q00994 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
BEX3Q00994 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
BEX3Q00994 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
BEX3Q00994 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
BEX3Q00994 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
BEX3Q00994 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
BEX3Q00994 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
BEX3Q00994 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
BEX3Q00994 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
BEX3Q00994 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
BEX3Q00994 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
BEX3Q00994 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
BEX3Q00994 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
BEX3Q00994 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
BEX3Q00994 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
BEX3Q00994 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
BEX3Q00994 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
BEX3Q00994 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
BEX3Q00994 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
BEX3Q00994 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
BEX3Q00994 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
BEX3Q00994 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
BEX3Q00994 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
BEX3Q00994 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
BEX3Q00994 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
BEX3Q00994 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
BEX3Q00994 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
BEX3Q00994 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
BEX3Q00994 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
BEX3Q00994 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
BEX3Q00994 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms